通过R协助自动进行SFTP传输

Question

我有一个一直在手动执行的SFTP进程。

注意：我要写的都不是我的实际登录凭证，因此请不要在评论中提出。

我的手动过程看起来像这样。

1. 打开终端
2. 输入open ftp://ftp.info.com/jsmith/Up
3. FTP客户端打开并询问我的用户名和密码
4. 我输入我的用户名：jsmith
5. 我输入密码：testpassword123
6. 我上传了文件

如何使用R自动完成整个过程？我使用什么软件包，脚本将是什么样？

Answer 1

如果您使用Windows，则建议使用PuTTY或WinSCP。如果在Linux上，请使用内置的或适合于操作系统的SFTP（请检查apt或yum存储库以获取适合您的OS的版本）。我个人使用WinSCP scripts。对于Macintosh，我建议使用CyberDuck。

您可以使用system() R函数将这些外部程序用于SFTP / SCP传输。此功能将允许您调用任何任意命令以传递到操作系统。

示例：

system("open sftp://username:password@sftp.example.com/", intern = F)

有关更多选项和示例，请参见?system。

您可以使用SSH密钥对进行无密码身份验证，也可以将密码存储为环境变量（并以这种方式传递值），或者理论上您可以通过将密码正确放在SFTP命令中来安全地执行此操作system()内。

system()是唯一的R命令，因此您只需遵循选择的任何SFTP程序的语法即可。如果您的文件名是根据日期在R中动态生成的，那么我将以相同的方式生成WinSCP脚本（将文件名和日期一起传递，就像您在注释中使用paste一样） 。有关命令，选项和WinSCP示例，请参见this。