感谢您的光临。
我正在尝试处理从.nd2到.TIF的约50张图像,但是导出的图像不是我所期望的,并且我不确定什么地方出错了。我的.nd2有两个频道,我希望最终的.TIF是这两个频道的图片。但是,我的代码的.TIF输出仅是一个通道的图像。
setBatchMode(true); //Batch mode processing setting in ImageJ
for (i=0; i<list.length; i++) {
showProgress(i+1, list.length);
filename = list[i];
setBatchMode(true); // prevents image windows from opening while the script is running
run("Bio-Formats Windowless Importer", "open=[" + dir1 + filename +"] autoscale color_mode=Composite rois_import=[ROI manager] view=DataBrowser stack_order=XYCZT");
selectWindow(filename);
run("Stack to RGB", "slices"); // convert to RGB stack
...在这部分代码之后,我拆分了z堆栈,找到了中间堆栈,并将该切片保存为.TIFF。
如果不清楚,请通知我。再次感谢您阅读。