我无法使用highcharter在R中创建交互式柱形图。这是我要使用的代码:
library(highcharter)
library(shiny)
library(shinydashboard)
library(extrafontdb)
testdata<-read.table("Matrix_Mean_sym.txt", header=TRUE)
testdata2<-t(testdata)
testdatase<-read.table("Matrix_SE_sym.txt", header=TRUE)
testdatase2<-t(testdatase)
ui<-dashboardPage(...
tabItem(tabName = "graph",
fluidRow(
box(title= "Gene Selection",
selectizeInput(inputId = "gene", "Gene Symbol:",
choices = colnames(testdata2),
selected="CD8A",
options = NULL,
multiple = FALSE)),
box(title= "Graph of Gene Expression",
highchartOutput("genePlot"))
))
server<- function(input, output) {
output$genePlot <- {
renderHighchart({
require(input$gene)
highchart() %>%
hc_add_series(data = list(testdata2[, input$gene]), type="column") %>%
hc_xAxis(categories = c('CD14+',
'CD19+',
'CD4+',
'CD56+',
'CD8+',
'Neutrophils',
'nRBCs',
'WB')) %>%
hc_title(text= "Graph of Gene Expression")
})}
我知道我没有提供有效的数据集,但这是来自140904元素矩阵的。每次运行此代码时出现的错误是:
如果(!已加载){:
条件的长度> 1,并且仅使用第一个元素
c(“正在加载必需的软件包:$”,“正在加载必需的软件包:输入”,“正在加载必需的软件包:基因”)
失败,错误:“'package'的长度必须为1”
输入到asJSON(keep_vec_names = TRUE)的是一个命名向量。在jsonlite的未来版本中,将不支持此选项,命名向量将转换为数组而不是对象。如果要输出JSON对象,请改用命名列表。请参阅?toJSON。
任何帮助,将不胜感激。谢谢!