需要将熊猫相关性高亮表(cmap Matplotlib)保存为png图像

时间:2018-07-15 10:15:27

标签: python matplotlib data-visualization data-science

使用此代码生成核对表:

df1.drop(['BC DataPlus', 'AC Glossary'], axis=1).corr(method='pearson').style.format("{:.2}").background_gradient(cmap=plt.get_cmap('coolwarm'), axis=1) 

这是生成的表: Correlation Table

我找不到任何将此表另存为图像的方法。谢谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

从字面上看,您提出的问题很难回答。 困难源于df.style.render()生成HTML,然后将其发送到浏览器以呈现为图像的事实。在所有浏览器中,结果可能也不完全相同。

Python并不直接参与图像的生成。所以没有 简单,基于Python的解决方案。

不过,如何将HTML转换为png的问题 was raised在熊猫开发者的 github页面和建议 答案是use phantomjs。其他方式(我尚未测试)可能是使用 webkit2pngGrabzIt

但是,如果我们松开对该问题的解释,我们可以避免很多困难。与其尝试生成df.style生成的确切图像(针对特定的浏览器),不如说是 我们可以使用seaborn很容易地生成相似图片:

import numpy as np
import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

df = pd.DataFrame(np.random.random((6, 4)), columns=list('ABCD'))
fig, ax = plt.subplots()
sns.heatmap(df.corr(method='pearson'), annot=True, fmt='.4f', 
            cmap=plt.get_cmap('coolwarm'), cbar=False, ax=ax)
ax.set_yticklabels(ax.get_yticklabels(), rotation="horizontal")
plt.savefig('result.png', bbox_inches='tight', pad_inches=0.0)

enter image description here


如果您不想添加Seaborn依赖性,则可以use matplotlib directly,尽管它需要多几行代码:

import colorsys
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt

df = pd.DataFrame(np.random.random((6, 4)), columns=list('ABCD'))
corr = df.corr(method='pearson')

fig, ax = plt.subplots()
data = corr.values
heatmap = ax.pcolor(data, cmap=plt.get_cmap('coolwarm'), 
                    vmin=np.nanmin(data), vmax=np.nanmax(data))
ax.set_xticks(np.arange(data.shape[1])+0.5, minor=False)
ax.set_yticks(np.arange(data.shape[0])+0.5, minor=False)
ax.invert_yaxis()
row_labels = corr.index
column_labels = corr.columns
ax.set_xticklabels(row_labels, minor=False)
ax.set_yticklabels(column_labels, minor=False)

def _annotate_heatmap(ax, mesh):
    """
    **Taken from seaborn/matrix.py**
    Add textual labels with the value in each cell.
    """
    mesh.update_scalarmappable()
    xpos, ypos = np.meshgrid(ax.get_xticks(), ax.get_yticks())
    for x, y, val, color in zip(xpos.flat, ypos.flat,
                                mesh.get_array(), mesh.get_facecolors()):
        if val is not np.ma.masked:
            _, l, _ = colorsys.rgb_to_hls(*color[:3])
            text_color = ".15" if l > .5 else "w"
            val = ("{:.3f}").format(val)
            text_kwargs = dict(color=text_color, ha="center", va="center")
            # text_kwargs.update(self.annot_kws)
            ax.text(x, y, val, **text_kwargs)

_annotate_heatmap(ax, heatmap)
plt.savefig('result.png', bbox_inches='tight', pad_inches=0.0)