Question

我正在mybinder.org中创建R环境（通过Github存储库）可执行文件。仅使用Jupyter集线器时，我的代码可以正常工作，但是在mybinder中执行代码时，install_github()函数无法正常工作（install.packages()等其他函数也可以正常工作）。不工作是指我运行此程序时的意思：

    install_github("hms-dbmi/Rcupcake", force = TRUE)

我明白了：

    Downloading GitHub repo hms-dbmi/Rcupcake@master
    from URL https://api.github.com/repos/hms-dbmi/Rcupcake/zipball/master
    Installing Rcupcake
    Installation failed: 'BiocInstaller' must be installed to  install Bioconductor packages

值得一提的是，我在Github存储库上创建了一个r ---格式的runtime.txt文件，在运行install_github()函数之前，我总是确保the devtools()函数已正确安装。尝试在mybinder环境中安装BiocInstaller时，出现以下提示：

    Installing package into ‘/srv/rlibs’
    (as ‘lib’ is unspecified)
    Warning message:
    “package ‘BiocInstaller’ is not available (for R version 3.4.4)”

我什至不知道为什么BiocInstaller问题确实会出现在mybinder中，因为在常规的Jupyter集线器环境中运行时我不必刻意安装它。

我不确定我在做什么错；我是mybinder的新手。如何使我的代码正常工作？我是否必须在github存储库中指定一个新文件？

谢谢您的帮助

install_github函数不适用于活页夹

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