我在哪里可以找到allensdk.CellTypesCache.get_cells（）返回的数据

Question

在allensdk版本0.14.5之前，CellTypesCache.get_cells()函数返回一个大型的嵌套结构，其中包含有关细胞形态，形态特征，位置，解剖结构，组织供体等的信息。在版本0.14.5中，返回的结构是扁平的，而且要小得多。

我看到其中一些信息可以通过get_ephys_features()和get_morphology_features()获得，但我不确定在哪里可以找到其余信息。在哪里可以找到如何将我的代码迁移到新的allensdk版本？

Answer 1

很好的问题。我们出于以下几个原因简化了CellTypesCache.get_cells中返回的字典的操作：

1. 有许多不同的字段：无法解释，没有用，分散注意力和/或具有从其他函数返回的数据的冗余性。
2. 处理大脑结构的方式使跨物种的皮质层过滤细胞变得非常困难。
3. 该查询涉及大量联接，并且运行缓慢。

（2）可能是我们需要解决的最紧迫的问题。此处将对新字典结构进行更详细的说明：

https://github.com/AllenInstitute/AllenSDK/wiki/Release-Notes-(0.14.5)

您应该寻求环保，这是正确的。和CellTypesCache.get_ephys_features和CellTypesCache.get_morphology_features（或仅CellTypesCache.get_all_features）的形态特征。

如果您在旧词典结构中使用的任何字段现在在当前词典中不可用，请告诉我，我们可以再次找到它们。