Question

我有一个这样的桌子

 bedGraph  chrom=chr1 chr1:0-000
    1000    0
    2000    0
    3000    0.003802
    4000    0.046175
 bedGraph  chrom=chr2 chr2:5000-6000
    5000    0.103756
    6000    0.161337

 EXPECTED RESULTS

bedGraph  chrom=chr1 rep
    1000    0
    2000    0
    3000    0.003802
    4000    0.046175
 bedGraph  chrom=chr2 rep
    5000    0.103756
    6000    0.161337

，我只想重命名第三个列（第二个列沿文件更改）。可以使用sed来做到这一点吗？谢谢！

Answer 1

对于给定的示例，此单线工作：

awk 'NF==3{$3="rep"}7' file

Answer 2

sed '/bedGraph/s/chr[12]:.*/rep/'

对于包含badGraph的行，用chr[1 or 2]:<anything>代替rep。

sed 's/^\([[:space:]]*[^[:space:]]\+[[:space:]]\+[[:space:]]\+[^[:space:]]\+[[:space:]]\+\)[^[:space:]]\+$/\1 rep/'

过滤并记住[[:space:]]*[^[:space:]]\+[[:space:]]\+[[:space:]]\+[^[:space:]]\+[[:space:]]\+行中的前两个单词，这在贝斯语中是<spaces or nothing><not spaces><spaces><not spaces><spaces>，然后用[^[:space:]]\+过滤掉第三个单词并打印前两个单词（即第一个单词）匹配），并用代表替换第三列。

如何在Linux中重命名列？

2 个答案: