我文件中的所有行都是标题/不对齐部分的一部分

时间:2018-07-09 01:10:50

标签: unix samtools

我目前正在对基因组进行highthroughput测序,并已生成SAM文件。

但是,我所有的行都有@sqSN正文标记,根据SAMTools网站,该标记仅应位于文件的标题行中。

有人知道这是为什么发生的,为什么即使我使用BWA程序对齐了序列,我的文件也没有对齐部分?

提前感谢您的帮助!

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