错误：“ RevoUtilsMath”的程序包或名称空间加载失败

Question

我对此问题有些疯狂。我试图在群集中的家中的环境（python 2.7）中使用conda安装R软件包（即没有root权限）。我首先使用以下命令在环境中安装了R：

conda install -c r r=3.4   

然后：

conda install -c conda-forge python-igraph  

（因为我感兴趣的图书馆需要igraph）

最后：

conda install -c conda-forge r-diffusionmap    

不幸的是，当我启动R时，出现以下消息：

  

错误：“ RevoUtilsMath”的包或名称空间加载失败：.onLoad   在'RevoUtilsMath'的loadNamespace（）中失败，详细信息：调用：NULL
  错误：删除Microsoft R，然后重新安装。确保选择MKL   库作为安装选项。

在启动过程中-警告消息： 软件包'RevoUtils'是在R版本3.4.3下构建的

是什么意思？我该怎么解决？

提前谢谢

Answer 1

当我在ubuntu平台（18.4）中为运行代码打开R时，对我来说，错误信息相同，并且没有其他有用的方法来解决它。我的R版本是3.4.3。enter image description here

Answer 2

在我的根R中安装了一些库（包括Rcpp）之后，但在conda环境（搞砸了conda）中没有安装同样的问题。每当打开运行R的jupyter笔记本时，这都会导致内核死亡。

对我来说，解决方法是：

1. Uninstall Anaconda3
2. 重新安装Anaconda3
3. 重新安装我需要的所有库（主要是R中的Bioconductor）

弹出其他一些问题，例如包装不一致，但我按照here所述处理了这些问题。

Answer 3

conda-forge（或Bioconda）上的所有R软件包都是针对一个新版本或每个新发行分支的R编译的（通常从补丁1开始，所以3.x.1 ，3.4.3除外。这是由于ABI不兼容问题造成的。

还要注意，defaults和conda-forge通道是not binary compatible（在这里they should be）的位置。自2018年以来，默认的anaconda渠道将Microsoft R Open发行为default R，是否最好将conda-forge中的所有软件包与conda-forge中的R一起使用。

您应该可以通过使用R安装conda install -c conda-forge r-base来解决此问题。