Question

我在PC上安装了DESeq2软件包，但最终没有使用它。我正在通过RStudio运行R，因此当我在PC或笔记本电脑上工作时，我将运行相同的RStudio项目文件。我在不安装DESeq2软件包的情况下将项目文件加载到笔记本电脑上后，控制台中不断弹出与DESeq2软件包相关的错误的问题开始出现。这可能与以下事实有关：我没有安装DESeq2，但是我不明白是什么导致尝试加载程序包。目前，我已经加载了ggplot2和MASS，并且错误只是不时弹出，污染了我的控制台，只是令人讨厌。

错误是：

Loading required package: DESeq2
Error in .requirePackage(package) : 
  unable to find required package ‘DESeq2’
In addition: Warning message:
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
  there is no package called ‘DESeq2’

Loading required package: DESeq2

Warning message:
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
  there is no package called ‘DESeq2’

我不确定在那种情况下需要什么DESeq2，因为我使用的是仅利用ggplot2的自定义函数。

有人知道如何提示错误以及如何阻止错误吗？

Answer 1

您的系统中的r库似乎没有名为Dseq2的软件包。只需输入给定命令即可安装该软件包。

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("DESeq2")

RStudio中DESeq2错误的一致垃圾邮件

1 个答案: