SearchIO.parse xml爆炸和“＆”号cElementTree.ParseError：格式不正确（无效的令牌）错误

Question

我想要一些建议来解决xml解析错误。在我的BLAST xml输出中，我有一个带有'＆'字符的描述，该描述抛弃了SearchIO.parse函数。

如果我运行

qresults=SearchIO.parse(PLAST_output,"blast-xml")

for record in qresults:
    #do some stuff

我收到以下错误：

cElementTree.ParseError: not well-formed (invalid token): line 13701986, column 30

将我引导至此行：

<Hit_def>Lysosomal & prostatic acid phosphatases [Xanthophyllomyces dendrorhous</Hit_def>

有没有一种方法可以在biopython中覆盖它，因此我不必更改xml文件？现在，我只是在做一个“ Try / Except”循环，但这并不是最佳选择！

感谢您的帮助！ 考特尼