我正在使用 Python 3.5.2 | Anaconda 4.3.0(x86_64)| (默认值,2016年7月2日,17:52:12) [与GCC 4.2.1兼容的Apple LLVM 4.2(clang-425.0.28)]
我必须运行以下命令
longList = list(combinations(range(2134), 3))
我知道这大约需要16亿美元。当我运行它时,一段时间后,我收到消息“内核似乎已经死亡。它将自动重新启动。”
运行3而不是2的同一命令没有任何问题:
longList = list(combinations(range(2134), 2))
在这种情况下我该怎么办?
答案 0 :(得分:0)
您可能用完了内存。快速计算:64位int或指针为8个字节大。您有16亿个组合,它们是元组。每个元组包含三个整数。这意味着您至少需要1.6E9 *(1 + 3)* 8B = 48GB内存。
但是,由于Python的内存模型,您将需要的次数更多:每个整数实际上是一个对象,因此我们需要1个机器字作为列表中的指针,并可能需要3或4个机器字作为对象本身(我不确定细节,请阅读CPython源文件中的实际对象布局)。元组对象也将有开销。我假设每个对象的开销为两个字。因此,我们必须增加额外的1.6E9 *(3 +1)* 2 * 8B = 95GB的额外开销,总计约为143GB。
这可以通过使用密集的numpy数组来避免,因为它使用实数而不是对象。这消除了整数和元组对象的所有开销,因此我们将“仅”需要1.6E9 * 3 * 8B = 35GB。
我认为您运行的内存不足。
您的combinations(..., 2)
调用不成问题,因为它仅产生大约200万个元组,其内存需求在兆字节范围内(2.2E6 *(1 + 4 + 2 * 3)* 8B = 180MB)。作为一个numpy数组,我们只需要2.2E6 * 2 * 8B = 33MB。
那这里的解决方案是什么?
dtype='int16'
,则减少4倍。)combinations()
转换为列表,还是可以懒散地或以较小的块使用迭代器