Question

我试图获得一个简单的R Markdown文档，该文档与Visual Studio（RTVS）2017（15.7.4）中的data.table包一起使用，无济于事。

这是最小可复制的.rmd文件（启用了一些可选的调试选项）：

---
title: "Untitled"
output: html_document
---

```{r knitr-setup, include = FALSE}
library(knitr)

knitr::opts_chunk$set(eval = TRUE)
opts_knit$set(progress = FALSE, verbose = TRUE)

```

```{r test_id, message=FALSE, results="show", echo=TRUE, warning=FALSE}

require(rmarkdown)
require(data.table, quietly = TRUE, warn.conflicts = FALSE)
options(datatable.verbose = TRUE)


DT = data.table(x=1:3, y=4:6)    # no
DT                               # yes
DT[, z := 7:9]                   # no
print(DT[, z := 10:12])          # yes
if (1 < 2) DT[, a := 1L]         # no
DT                               # yes
```

Some text.

```{r}
sessionInfo()
```

我看过类似症状的类似问题，

data.table error when used through knitr, gWidgetsWWW

我已经尝试过与我在“ devtools”软件包开发中使用命名空间类似的命名空间覆盖，

https://github.com/rstudio/rmarkdown/issues/278

我认为这可能与我引用程序包（或命名空间等）有关。但是，完全相同的文件在“ R Studio”中可以完全正常运行。所以我不确定是这种情况。

我得到的错误是：

R评估失败：

rtvs :: rmarkdown_publish（blob_id = 29，output_format =“ html_document”，   encoding ='cp1252'）

'：='（z，7：9）中的错误：检查is.data.table（DT）== TRUE。   另外，：=和'：='是在j中为我们定义的，仅一次且在   特定方式。请参阅help（“：=”）。

同样，同一文档在 R Studio 中完全没有问题。

我确实注意到这两个shell对pandoc的调用略有不同：

R Studio通话：

“ C：/ PROGRA〜2 / Pandoc / pandoc” + RTS -K512m -RTS dt_error.utf8.md-至 html4 --from markdown + autolink_bare_uris + ascii_identifiers + tex_math_single_backslash + smart --output dt_error.html-电子邮件混淆无-自包含-独立--section-divs --template“ C：\ Users \ bmore \ Documents \ R \ win-library \ 3.5 \ rmarkdown \ rmd \ h \ default.html” --no-highlight --variable highlightjs = 1 --variable“ theme：bootstrap” --include-in-header“ C：\ Users \ bmore \ AppData \ Local \ Temp \ Rtmp0cb9Vo \ rmarkdown-stra0bc15f917ea.html” --mathjax --variable“ mathjax-url：https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML”

Visual Studio调用：

“ C：/ PROGRA〜2 / Pandoc / pandoc” + RTS -K512m -RTS rmd_8c885bcf5786.utf8.md -至html4-从markdown + autolink_bare_uris + ascii_identifiers + tex_math_single_backslash + smart --output pandoc8c8870d27b22.html-电子邮件混淆无-自包含-独立--section-divs --template“ C：\ Users \ bmore \ Documents \ R \ win-library \ 3.5 \ rmarkdown \ rmd \ h \ default.html” --no-highlight --variable highlightjs = 1 --variable“ theme：bootstrap” --include-in-header“ C：\ Users \ bmore \ AppData \ Local \ Temp \ Rtmp429dUm \ rmarkdown-str8c886f7837b1.html” --mathjax --variable“ mathjax-url：https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML”

我还向Visual Studio Developer community提交了一个错误报告，但是，我不完全相信如果不更改IDE就无法解决它。

注意：上面的代码可以在IDE /交互模式下正常运行，当尝试“编织”为任何输出类型（html，pdf，doc）时，会发生错误。 / em>

sessionInfo()


R版本3.5.0（2018-04-23）平台：x86_64-w64-mingw32 / x64（64位）   运行于：Windows 10 x64（内部版本17134）

Matrix产品：默认

语言环境：1 LC_COLLATE = English_United States.1252   LC_CTYPE = English_United States.1252 LC_MONETARY = English_United   状态1252 LC_NUMERIC = C
  LC_TIME =英语_美国。1252

附加的基本软件包：1统计信息图形grDevices utils
  数据集方法基础

其他附加软件包：1 rmarkdown_1.10 knitr_1.20
  ggplot2_2.2.1 dplyr_0.7.6 data.table_1.11.4

通过名称空间（未附加）加载：1 Rcpp_0.12.17
  绑定器_0.1.1 magrittr_1.5 rtvs_1.0.0.0 tidyselect_0.2.4   munsell_0.5.0 colorspace_1.3-2 R6_2.2.2 rlang_0.2.1
  stringr_1.3.1 plyr_1.8.4 tools_3.5.0 grid_3.5.0
  gtable_0.2.0 [15] htmltools_0.3.6 yaml_2.1.19
  rprojroot_1.3-2 lazyeval_0.2.1断言_0.2.0摘要_0.6.15
  tibble_1.4.2 bindrcpp_0.2.2 purrr_0.2.5评估_0.10.1   胶水_1.2.0 labeling_0.3字符串i_1.1.7编译器_3.5.0

Answer 1

此问题已在data.table_1.11.8中得到确认，随后根据@Hugh Ugh的上述评论进行了确认。

但是，如果由于某种原因，任何人由于某种原因而不得不使用data.table的早期版本，则解决方法是添加：

assignInNamespace("cedta.pkgEvalsUserCode", c(data.table:::cedta.pkgEvalsUserCode, "rtvs"), "data.table")

在脚本块中，如下所示：

```{r additional-libraries, echo=FALSE}

    library(data.table, quietly = TRUE, warn.conflicts = FALSE)

    assignInNamespace("cedta.pkgEvalsUserCode", c(data.table:::cedta.pkgEvalsUserCode, "rtvs"), "data.table")

    }
    ```

RTVS：无法使用data.table

1 个答案: