NCBI Esearch通过R控制台运行，但不通过R Studio运行

Question

我可以通过R控制台运行命令行电子搜索查询，它会为我返回预期的结果，但是它将无限期挂起并使R Studio崩溃。 R和R Studio处理这些命令的方式是否有所不同？在两种环境下，我的路径都相同。

system(paste("esearch -db assembly ",
             "-query ",
             "'", "archaea[organism] and ", '"', "complete genome", '"',
             "[filter]",
             " AND ",
             '"', "latest refseq", '"',
             "[filter]",
             '"',
             "'",
             " | ",
             "efetch -format docsum | xtract -pattern DocumentSummary -block FtpPath -match ",
             '"',
             "@type:refseq",
             '"',
             " -element FtpPath | ",
             "sed ", "'", "s", '/', '$', '/', '\\', '//', "'",
             " > ftpdirpaths",
             sep = ""))