Question

我有一个运行中的Docker容器，带有经过稍微修改的rocker/shiny映像中的闪亮服务器。

默认的shiny-server.conf文件将闪亮的用户设置为下一个用户

# Define the user we should use when spawning R Shiny processes
run_as shiny;

表示默认情况下服务器以root用户身份运行，但是闪亮应用的工作进程以用户 shiny

身份运行

应用程序本身使用通过RODBC初始化的与SQL Server的数据仓库连接。虽然我们不想将整个连接详细信息字符串（包括数据库主机和密码）放入代码库中，但我们想通过运行以下例程从使用容器创建的环境变量中读取它们

HOST <- Sys.getenv("host")
DB <- Sys.getenv("db")
UID <- Sys.getenv("uid")
PWD <- Sys.getenv("pwd")

conn<-paste0("driver={ODBC Driver 17 for SQL Server};server=",HOST,";database=",DB,";uid=",UID,";pwd=",PWD)
dbhandle<-odbcDriverConnect(conn)

问题在于，当容器中以用户 shiny 的身份生成工作进程时，这些env变量为空。

如果我尝试在交互式R控制台中（以 root 或 shiny 用户身份）运行相同的代码，则会得到预期的env变量。

任何输入将不胜感激。请注意，我不打算使用Docker机密，因为我不是在docker swarm集群中运行应用程序，而只是在独立的Rancher OS主机中运行。

编辑：尽管.Renviron文件可能是解决该特定问题的可行替代方案，但它将需要将变量放入代码库中，我们在此处尝试避免这种情况。

Answer 1

根据Ralf Stubner的建议，我在shiny-server.sh启动脚本（即docker容器的CMD）中添加了以下内容：

env > /home/shiny/.Renviron
chown shiny.shiny /home/shiny/.Renviron

在容器内生成闪亮的进程时保留环境变量

1 个答案: