我有一个实例布尔蒙版,它的形状为448个实例,形状为(448,1000,1000),实例的平均像素约为100。
现在,如果我有一个形状为(1000,1000)的预测矩阵并按整数预测实例,即如果该矩阵预测500个实例,则np.unique(pred)将为501(500类+ 1个背景)。 / p>
我需要为每对预测和掩码计算IOU(jaccard索引)以找到最大IOU。我在下面编写了代码,但是它非常慢且效率低。
c = 0 #intersection count
u = 0 #union count
pred_used = [] #record prediction used
# loop for every ground truth mask
for idx_m in range(len(mask[:,0,0])):
m = mask[idx_m,:,:] #take one mask
intersect_list = []
union_list = []
# loop every prediction
for idx_pred in range(1, int(np.max(pred))+1):
p = (pred==idx_pred) # take one prediction mask
intersect = np.sum(m.ravel() * p.ravel()) #calculate intersect
union = np.sum(m.ravel() + p.ravel() - m.ravel()*p.ravel())
intersect_list.append(intersect)
union_list.append(union_list)
if np.sum(intersect_list) > 0:
idx_max_iou = np.argmax(np.array(intersect_list))
c += intersect_list[idx_max_iou]
u += union_list[idx_max_iou]
pred_used.append(idx_max_iou)
答案 0 :(得分:1)
因此,您有一个尺寸为[1000,1000]的输出图像,它是模型预测的数组/张量。
您可以做的第一件事就是将标签和预测的形状从[1000,1000]调整为[1000 * 1000,]。这样可以将复杂度从N ^ 2降低到N。这应该大大提高速度。
您还可以尝试使用Scikit的IoU,它可能比您的版本要快一些。
您可以在此处找到示例:How to find IoU from segmentation masks?
文档:http://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.metrics.jaccard_similarity_score.html