Holoviews图形可视化:基于属性设置位置

时间:2018-06-26 21:30:38

标签: python graph networkx bokeh holoviews

在Holoviews中绘制网络时,如何基于属性设置节点的位置?我的每个节点都有一个带有时间戳的网络,并希望根据相关的时间来定位节点。

1 个答案:

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我想出了如何基于属性设置x位置的方法,但是我仍然希望全息视图找到最佳的y位置(请参见Holoviews graph visualization: get optimal y position, given x position)。

下面的代码根据节点属性设置x位置:

import holoviews as hv
import numpy as np
import pandas as pd
import networkx as nx

N = 5
num_edges = 2
list1 = np.arange(N).tolist()*num_edges
list2 = np.array(list1)
np.random.shuffle(list2)
edgelist = pd.DataFrame({'vertex1': list1, 'vertex2': list2, 'weight': np.random.uniform(0, 1, len(list1))})
edgelist = edgelist[edgelist.vertex1 != edgelist.vertex2]
edgelist = edgelist.drop_duplicates()
times = pd.DataFrame({'vertex': np.arange(N), 'time': np.random.normal(0, 10, N)})

x = times.time
y = np.random.uniform(0, 1, N)
padding = dict(x=(np.min(x) - 1, np.max(x) + 1), y=(-1.2, 1.2))
node_indices = np.arange(N)


pos_graph = hv.Graph(((edgelist.vertex1, edgelist.vertex2), (x, y, node_indices))).redim.range(**padding)
pos_graph