我可以将TIFF图像作为NumPy数组加载到内存中,其中每个像素由3元素RGB向量表示:
.projects {
height: 100%;
width: 100%;
display: flex;
justify-content: center;
align-items: flex-start;
}
例如,上面的arr可能具有形状(2469,2858,3)。
在Bokeh docs之后,在散景中,像素是一维数字,相对于颜色图进行解释。
如何将我的3D RGB TIFF数组映射到1D Bokeh色彩映射索引数组,我应该使用哪种色彩映射?
This post建议我应该编写一个称为RGBAColorMapper的东西。我该怎么办?
还有一个叫image_rgba的东西,它是一个4D像素,我如何将3D像素转换为4D以使用它?
基本上,我正在寻找与MatPlotLib imshow相同的功能。
答案 0 :(得分:5)
您可以使用PIL软件包将tiff图像转换为rgba。然后使用image_rgba可以很容易地进行绘制。按照http://www-eng-x.llnl.gov/documents/tests/tiff.html的SO答案,从here下载了tiff文件。
import numpy
from PIL import Image
from bokeh.plotting import figure, show
im = Image.open('a_image.tif')
im = im.convert("RGBA")
# uncomment to compare
#im.show()
imarray = numpy.array(im)
p = figure(x_range=(0,10), y_range=(0,1), width=1000, height=200)
p.image_rgba(image=[imarray], x=0, y=0, dw=10, dh=1)
show(p)