如何为pycaffe创建3D数据的HDF5数据库？

Question

我的问题听起来很简单，但是，我很难从以nii格式保存的3d医学图像中创建Hdf5数据集，以用于图像和手动分割（标签文件）。我的问题是：

1. pycaffe中的斑点形状为N*C*W*H，在matcaffe中是不同顺序吗？例如，在pycaffe中，宽度和高度分别为320 x 320和60个切片的灰度体积的数据blob形状将为1*1*60*320*320。我尝试使用Matlab code为3D数据创建HDF5数据集，而hdf5info和320*320*60*1*1文件中的blob顺序均为data label。我应该如何更改Matlab代码中的顺序以使其在Pycaffe中可读？
2. 是否有用于创建3D数据的hdf5数据库的python代码？
3. 如果我在Matlab中创建hdf5数据并使用pycaffe列表，会引发问题吗？

谢谢

Answer 1

Matlab从第一个维度到最后一个维度（例如fortran）排列ND数组中的元素，而caffe和hdf5从最后一个维度到第一个维度（“ col-major”）存储数组。
This answer说明了如何简单地修改Matlab的代码以将“ col-major”数组写入HDF5文件。
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