Question

我正在尝试使用Keras软件包在Python中绘制深度学习模型的图/图，但不幸的是，它一直给我一个错误，信息不多。

我在具有Python 3.5.2，Anaconda 4.2.0，Keras 2.1.6的Linux上运行python，并使用tensorflow-gpu 1.7.0后端。

这是错误消息：

keras.utils.plot_model(unet, to_file='model.png', show_shapes=False, show_layer_names=True, rankdir='TB')

['dot', '-Tps', '/tmp/tmphesl1j0c'] return code: 127

stdout, stderr:
 b''
b'dot: error while loading shared libraries: libexpat.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory\n'

---------------------------------------------------------------------------
AssertionError                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-9-60bb0e3b97bd> in <module>()
----> 1 keras.utils.plot_model(unet, to_file='model.png', show_shapes=False, show_layer_names=True, rankdir='TB')

/.../anaconda3-4.2.0/lib/python3.5/site-packages/keras/utils/vis_utils.py in plot_model(model, to_file, show_shapes, show_layer_names, rankdir)
    132             'LR' creates a horizontal plot.
    133     """
--> 134     dot = model_to_dot(model, show_shapes, show_layer_names, rankdir)
    135     _, extension = os.path.splitext(to_file)
    136     if not extension:

/.../anaconda3-4.2.0/lib/python3.5/site-packages/keras/utils/vis_utils.py in model_to_dot(model, show_shapes, show_layer_names, rankdir)
     53     from ..models import Sequential
     54 
---> 55     _check_pydot()
     56     dot = pydot.Dot()
     57     dot.set('rankdir', rankdir)

/.../anaconda3-4.2.0/lib/python3.5/site-packages/keras/utils/vis_utils.py in _check_pydot()
     24         # Attempt to create an image of a blank graph
     25         # to check the pydot/graphviz installation.
---> 26         pydot.Dot.create(pydot.Dot())
     27     except OSError:
     28         raise OSError(

/.../anaconda3-4.2.0/lib/python3.5/site-packages/pydot.py in create(self, prog, format, encoding)
   1882                      out=stdout_data,
   1883                      err=stderr_data))
-> 1884         assert p.returncode == 0, p.returncode
   1885         return stdout_data

AssertionError: 127

如果有人可以帮助我解决这个错误，我将不胜感激。

注意：pydot和graphviz均已安装

Answer 1

我将 keras.utils 更改为 tensorflow.keras.utils，它对我有帮助

Answer 2

对我来说，解决方案是这样导入：

from keras.utils.vis_utils import plot_model

Answer 3

评论说

 24         # Attempt to create an image of a blank graph
 25         # to check the pydot/graphviz installation.

所以我想您需要安装graphviz和pydot

假设您使用的是ubuntu或类似版本：

sudo apt install graphviz

以及您的anaconda env：

pip install pydot

Answer 4

似乎存在一些兼容性问题！（see）

对我来说，安装Link并将其添加到Graphviz即可。

Answer 5

对我来说解决方案是：

conda install pydotplus（pydot-ng不能通过tensorflow-gpu安装）。
在anaconda目录中搜索viz_utils.py并将其全部打开。确保在所有地方都导入了pydot，它是通过以下方式完成的：

try:
  # pydot-ng is a fork of pydot that is better maintained.
  import pydot_ng as pydot
except ImportError:
  # pydotplus is an improved version of pydot
  try:
    import pydotplus as pydot
  except ImportError:
    # Fall back on pydot if necessary.
    try:
      import pydot
    except ImportError:
      pydot = None

其中一个文件只是说import pyplot。更改之后，它对我有用。

Answer 6

我解决了program += extension中的问题注释行117 pydot.py

Answer 7

如果您运行的是 PyCharm 之类的 IDE，则在安装 pydot 并安装 Graphviz 之后（还将其添加到环境 PATH 变量。例如 C:\Program Files\Graphviz\bin。参见此处 {{ 3}})，您应该重新启动 IDE。

如果您在虚拟环境中工作，我建议您停用并重新启动终端，然后再次激活虚拟环境。

原因 - 包试图从 os.environ['PATH'] 定位 graphviz，但不知何故它没有更新以在路径中显示 graphviz。重新启动 Pycharm 后，我发现 os.environ['PATH'] 已正确更新并且 plot_model 函数正常工作。

Answer 8

from keras.utils.vis_utils import plot_model
keras.utils.vis_utils.plot_model(
csf1, to_file='model.png', show_shapes=True, show_dtype=True,
show_layer_names=True, rankdir='TB', expand_nested=True, dpi=96
)

您可以使用此代码，它适用于我的项目。

尝试使用keras.utils.plot_model时发生错误

8 个答案: