我正在尝试使用tifffile保存tiff堆栈,并使用this solution添加ImageJ tiff元数据标记和值。
代码运行没有错误,但是当我在ImageJ中打开“图像信息”时,看不到我创建的新标签。
我真的不知道Tiff标签是如何工作的,所以我选择了一个名为“名称”的标签,因为当我打开用ImageJ保存的元数据时,该标签名称就存在了。
我只更改了原始解决方案的功能以支持我的标签。 这是我正在使用的代码:
def imagej_metadata_tags(metadata, byteorder):
"""Return IJMetadata and IJMetadataByteCounts tags from metadata dict.
The tags can be passed to the TiffWriter.save function as extratags.
"""
header = [{'>': b'IJIJ', '<': b'JIJI'}[byteorder]]
bytecounts = [0]
body = []
def writestring(data, byteorder):
return data.encode('utf-16' + {'>': 'be', '<': 'le'}[byteorder])
def writedoubles(data, byteorder):
return struct.pack(byteorder+('d' * len(data)), *data)
def writebytes(data, byteorder):
return data.tobytes()
metadata_types = [
('Name', b'Name', 1, writestring),
]
for key, mtype, count, func in metadata_types:
if key not in metadata:
continue
if byteorder == '<':
mtype = mtype[::-1]
values = metadata[key]
if count is None:
count = len(values)
else:
values = [values]
header.append(mtype + struct.pack(byteorder+'I', count))
for value in values:
data = func(value, byteorder)
body.append(data)
bytecounts.append(len(data))
body = b''.join(body)
header = b''.join(header)
data = header + body
bytecounts[0] = len(header)
bytecounts = struct.pack(byteorder+('I' * len(bytecounts)), *bytecounts)
return ((50839, 'B', len(data), data, True),
(50838, 'I', len(bytecounts)//4, bytecounts, True))
ijtags = imagej_metadata_tags({'Name': 'DPY'}, '>')
tif.imsave(some_path, frame, imagej=True, extratags=ijtags)
答案 0 :(得分:1)
IJMetadata
标签只能包含特定于应用程序的信息。请参见imagej_metadata_tag
函数的用法。您可以指定metadata={'Name': 'A name'}
将其他元数据保存在ImageDescription
标记中。 ImageJ可能会或可能不会使用此信息。 ImageJ使用的TIFF标签没有记录。