R闪亮的表不渲染

时间:2018-06-19 04:58:03

标签: r shiny

我尝试使用renderTable创建一个表,但它没有在浏览器上呈现。这是ss @ imgur

全桌code

这是renderTable代码:

library(shiny)
library(diceR)

output$clustensemble <- renderTable({
#load file
data <- data()

#consensus cluster
cc <- consensus_cluster(data, nk=3, reps=1, algorithms=c("km","hc"), progress=FALSE)
ce <- as.matrix(cc)
tce <- t(ce)
tce })

我尝试过使用

  

sanitize.text.function = function(x)x;

但它没有工作,如here

中所述

我也尝试过使用renderUI,但它会产生另一个错误。

该表由数字和字符串组成,但我认为这不是问题。 在这种R项目中仍然是新的,所以我不知道任何其他解决方案。我该怎么办,这个问题的原因是什么?谢谢!

(编辑)

Sample data csv

ui.R

server.R

app.R

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

没有看到您使用的数据和ui,我们只能猜测。 使用来自diceR的示例数据,我可以使用基础shinyDT打印出表格。

library(shiny)
library(DT)
library(diceR)

data(hgsc)
# Custom distance function
manh <- function(x) {
  stats::dist(x, method = "manhattan")
}
# Custom clustering algorithm
agnes <- function(d, k) {
  return(as.integer(stats::cutree(cluster::agnes(d, diss = TRUE), k)))
}
assign("agnes", agnes, 1)

ui <- fluidPage(
  DT::dataTableOutput("tableDT"),
  tableOutput("table")
)

server <- function(input, output){

  data <- reactive({
    dat <- hgsc[1:10, 1:50]
    cc <- consensus_cluster(dat, reps = 6, algorithms = c("pam", "agnes"),
                            distance = c("euclidean", "manh"), progress = FALSE)
    ce <- as.matrix(cc)
    t(ce)
  })

  output$tableDT <- DT::renderDataTable({
    data()
  })

  output$table <- renderTable({
    data()
  })
}

shinyApp(ui, server)