Question

Ordiellipse plot, part of ellipses are shown in bottom left corner, no other information is shown

我正在尝试创建一个NMDS图，其中蜂种数据按地雷的存在/不存在分组。在下面的代码行中，beematrix =按地点划分的物种丰度和beesmine =定义哪些地点包含采矿区域。

beematrix=read.csv(file.choose(), row.names = 1)
beesmine=read.csv(file.choose(), row.names = 1)
beesmatrix=as.matrix(beematrix)
beematrix=t(beesmatrix)
library(vegan)
rankindex(beematrix, beematrix)
bees.nmds=metaMDS(beematrix, distance = "kulczynski")
for (i in 1:5) print (metaMDS(beesmatrix, distance = "kulczynski", k=i, trace = FALSE)$stress*100)
bees.nmds=metaMDS(beesmatrix, distance = "kulczynski", k=3)
plot(bees.nmds)
plot.new()
ordiellipse(bees.nmds, groups=beesmine$Mine,label = TRUE)
##ordiellipse is smushed into corner of screen and is impossible to read

Answer 1

不使用awk 'BEGIN {FS=OFS=", "} {print} END {print ++$1,"namaste, hindi"; print ++$1,"hallo, german"}' file：它会破坏之前的情节和错误plot.new。函数ordiellipse会将添加省略号添加到现有排序图中，但在使用ordiellipse销毁所有存在的图片后，您没有现有的图。

是什么导致您使用plot.new()？

如何更改ordiellipse图的图形参数？ Ordiellipse图切断数据

1 个答案: