在question之后我尝试使用带有Cython
的C ++ DLL,并且教程适合我从未起作用的情况,我决定使用ctypes
。我现在使用ctypes成功调用了我感兴趣的函数,这要归功于大量的SO浏览。我现在面临的问题是在Python中使用结构数组结构。
这个C函数如下:
void myfun(
double a,
//...more double parameters
int max_iter,
int * nb_iter,
myStruct * res_arr,
bool * ok
);
myStruct
定义如下:
typedef struct {
double dat;
int k;
int m;
// ... more int
double b;
double v;
//...more double
} myStruct;
我通过以下Python代码调用此函数:
import ctypes
lib = ctypes.CDLL('PATH_TO_DLL\\lib.dll')
myFunPy = getattr(lib,"?myFun@@YANNNNN_BUNCH_OF_Ns_NNNHPEAHPEAUmyStruct@@PEA_N@Z") # name found through dumpbin.exe (due to C++)
class myStruct(ctypes.Structure):
_fields_ = [("k", ctypes.c_int),
("m", ctypes.c_int),
#...more int parameters
("b", ctypes.c_double),
("v", ctypes.c_double)
#...more double parameters
]
myFunPy.argtypes = [ctypes.c_double,
// ... more double parameters
ctypes.c_int,
ctypes.POINTER(ctypes.c_int),
ctypes.POINTER(myStruct),
ctypes.POINTER(ctypes.c_bool)]
myFunPy.restype = ctypes.c_void_p
max_iter = 10000
a = ctypes.c_double(0.1)
// ... more double parameters definitions
nb_iter = ctypes.c_int(0) # value doesn't matter, it is initialized in myFun
ok = ctypes.c_bool(True)
res_arr = (myStruct * max_iter)()
myFunPy(a, ..., max_iter, ctypes.byref(nb_iter), res_arr, ctypes.byref(ok))
现在myFun
修改res_arr
这是一个struct数组,从上面的代码可以看出。
这完全是
<__main__.myStruct_Array_10000 at 0x97966c8>)
在上面显示的代码之后,但我无法理解如何将其转换为NumPy数组以供将来使用高效。
当然,我可以使用for field, _ in struct._fields_
之类的东西进行循环,如here所示,但这不是重点,因为我使用DLL来使计算更快(我真的看到了执行时间处理时间)。 res_arr
的范围从200 kb到1 Mb,并且有数万行和几十列,所以我确信有一种方法可以不通过循环来完成所有这些,但我不能弄清楚如何做得很好。
似乎如果它不是一个struct数组,那就更容易了。有a few SO questions(here,here,here和here)关闭对于这个主题,但它要么只是转换一个结构,只是一个数组,或者一些接近但从未完全像我这样的东西,而且我没有成功地适应这些解决方案,所以也许有一种方法可以基于此解决问题,但是无论如何我都是耳朵。
答案 0 :(得分:1)
我们几乎遇到相同的问题,但就我而言,我使用的是CUDA DLL,因此我的编译器为nvcc
。但是我相信这也可以通过普通的g++
编译器来完成。无论如何,这是我为了将结构数组从CPP文件转换为可用的Python列表/数组而执行的步骤。我不会检查您的代码;相反,我仅向您提供示例,可在此处找到:https://github.com/jcbacong/python-cpp.git
但是重要的步骤总结如下:
使用必要的头文件创建一个.cpp文件,该头文件包含函数的extern "C"
声明。在我的.cpp文件中,我返回了一个struct数组,而不是返回了void
。
使用编译器创建一个.dll文件。同样,就我而言,它是nvcc
。我通过github帐户链接的示例代码是使用nvcc
编译的。
在您的.py文件中:
3.1使用ctypes.Structure
创建Python类,以便在.cpp / .h文件中复制结构定义。
3.2使用argtype/restype
初始化输入/输出。由于我的.cpp函数返回一个结构数组,因此restype
由ctypes.Pointer(<your Python Class(ctypes.Structure)>)
给出。
3.3我将所有输入都转换为可读的ctype。在我的.py文件中调用该函数之后,可以使用(_results
)将所得的结构数组(在示例中为results = _results[:ARRAY_SIZE]
)转换为Python列表。
我希望这会有所帮助!