如何在R中检查文件的幻数(或十六进制签名)?

时间:2018-06-10 17:45:52

标签: r file compression bzip2

我想检测对象的文件类型,以确定压缩文件的正确连接(例如,是否使用bzfile gzfilexzfile等。显然我可以根据文件扩展名“猜测”,但我的理解是检查magic number会更加健壮(虽然我有点不清楚它是否可移植到基于Windows的架构?)

如何返回文件的幻数以确定它是否确实是BZh

请注意,我想要一个适合在包开发中使用的解决方案;例如将尽可能在操作系统之间移植,而不是特定于* nix系统。

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

Github上有几个软件包以某种方式使用libmagic:

答案 1 :(得分:1)

我找不到已经编写过在R中本地执行此操作的包或函数。虽然我认为刮取wiki引用表(或获取magic.mgc的副本并解析它)相对简单直接并且使用readBin或类似的,我认为跨平台使用的更直接的方法是使用file命令。当Rtools不可用时,唯一缺乏跨平台的是Windows。

我创建了两个文件,创造性地命名为" gz"和" bz2",并运行此测试。

ptns <- list(gzip="gzip compressed data",
             bzip2="bzip2 compressed data",
             pdf15="PDF document, version 1.5",
             xlsx="Microsoft Excel")

files <- c("gz", "bz2")
out <- system2("file", args=files, stdout=TRUE)

setNames(sapply(out, function(o) {
  thistype <- "unk"
  for (j in seq_along(ptns)) {
    if (grepl(ptns[[j]], o)) {
      thistype <- names(ptns)[j]
      break
    }
  }
  thistype
}), files)
#      gz     bz2 
#  "gzip" "bzip2" 

我在内部选择for循环的原因是我希望它在成功匹配后中断执行。