实际上我提出了一个非常好的问题,我提出了一个解决方案(见下文),但这并不美观:
假设你有一个向量x 和一个矩阵A ,它包含第一列中间隔的开始和第二列中间隔的结束。 /> 如何获得A 的元素,这些元素属于A 给出的区间?
x <- c(4, 7, 15)
A <- cbind(c(3, 9, 14), c(5, 11, 16))
预期产出:
[1] 4 15
如果这有助于提高绩效,您可以获得以下信息:
矩阵的向量和行都是有序的,间隔不重叠。所有间隔都具有相同的长度。所有数字都是整数,但可以巨大。
现在我不想懒惰并提出以下解决方案,这对于长矢量和矩阵来说太慢了:
x <- c(4, 7, 15) # Define input vector
A <- cbind(c(3, 9, 14), c(5, 11, 16)) # Define matrix with intervals
b <- vector()
for (i in 1:nrow(A)) {
b <- c(b, A[i, 1]:A[i, 2])
}
x[x %in% b]
我知道 R 中的循环可能很慢,但我不知道如何在没有一个的情况下编写操作(也许有apply
的方法。)
答案 0 :(得分:1)
我们可以使用sapply
循环遍历x
的每个元素,并查找它是否位于这些矩阵值的any
范围内。
x[sapply(x, function(i) any(i > A[, 1] & i < A[,2]))]
#[1] 4 15
如果length(x)
和nrow(A)
相同,那么我们甚至不需要sapply
循环,我们可以直接使用此比较。
x[x > A[, 1] & x < A[,2]]
#[1] 4 15
答案 1 :(得分:1)
这是一种不使用显式循环或应用函数的方法。 outer
有时要快得多。
x[rowSums(outer(x, A[,1], `>=`) & outer(x, A[,2], `<=`)) > 0]
[1] 4 15
答案 2 :(得分:0)
这个答案很晚,但是今天我有同样的问题要解决,我的答案可能对将来的读者有所帮助。我的解决方案如下:
f3 <- function(x,A) {
Reduce(f = "|",
x = lapply(1:NROW(A),function(k) x>A[k,1] & x<A[k,2]),
init = logical(length(x)))
}
此函数返回一个长度为(x)的逻辑向量,指示是否可以在间隔中找到x中的相应值。如果我想获取元素,我只需要写
x[f3(x,A)]
我做了一些基准测试,并且在使用较大数据进行测试时,我的功能似乎运行良好。 让我们定义本文中建议的其他解决方案:
f1 <- function(x,A) {
sapply(x, function(i) any(i > A[, 1] & i < A[,2]))
}
f2 <- function(x,A) {
rowSums(outer(x, A[,1], `>`) & outer(x, A[,2], `<`)) > 0
}
现在它们还返回逻辑向量。 我的计算机上的基准测试如下:
x <- c(4, 7, 15)
A <- cbind(c(3, 9, 14), c(5, 11, 16))
microbenchmark::microbenchmark(f1(x,A), f2(x,A), f3(x,A))
#Unit: microseconds
# expr min lq mean median uq max neval
#f1(x, A) 21.5 23.20 25.023 24.30 25.40 61.8 100
#f2(x, A) 18.8 21.20 23.606 22.75 23.70 75.4 100
#f3(x, A) 13.9 15.85 18.682 18.30 19.15 52.2 100
似乎没有什么大的区别,但是下面的示例将使它更加明显:
x <- seq(1,100,length.out = 1e6)
A <- cbind(20:70,(20:70)+0.5)
microbenchmark::microbenchmark(f1(x,A), f2(x,A), f3(x,A), times=10)
#Unit: milliseconds
# expr min lq mean median uq max neval
#f1(x, A) 4176.172 4227.6709 4419.6010 4484.2946 4539.9668 4569.7412 10
#f2(x, A) 1418.498 1511.5647 1633.4659 1571.0249 1703.6651 1987.8895 10
#f3(x, A) 614.556 643.4138 704.3383 672.5385 770.7751 873.1291 10
可以检查所有函数返回相同结果的方法,例如通过:
all(f1(x,A)==f3(x,A))