我冒险在R中使用Reticulate并且在安装软件包时遇到问题,特别是psycopg2
但我也尝试使用相同的结果安装twisted
。
在R中加载reticulate
后,我仔细检查以确保我的软件包已安装:
> conda_install(envname = "r-reticulate", packages="psycopg2")
Solving environment: ...working... done
# All requested packages already installed.
看起来不错。所以我把我的condaenv设置为r-reticulate
只是为了双重确定。文档说我不应该这样做,但它不应该受到伤害:
> use_condaenv( "r-reticulate")
然后我尝试导入psycopg2
:
> psycopg2 <- import('psycopg2')
Error in py_module_import(module, convert = convert) :
ImportError: No module named psycopg2
如果我以同样的方式安装twisted
,我会收到同样的错误:
> twisted <- import('twisted')
Error in py_module_import(module, convert = convert) :
ImportError: No module named twisted
那么,我在这里做错了什么?
以下是conda_list
和py_config
的输出...我期待py_config
向我展示我r-reticulate
环境中python exe的路径。但是我没有什么可以比较的,所以我的期望可能是错的。
> conda_list()
name python
1 Anaconda C:\\Users\\jal\\AppData\\Local\\Continuum\\Anaconda\\python.exe
2 r-reticulate C:\\Users\\jal\\AppData\\Local\\Continuum\\Anaconda\\envs\\r-reticulate\\python.exe
> py_config()
python: C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
libpython: C:/Users/jal/AppData/Local/CONTIN~1/Anaconda/python27.dll
pythonhome: C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda
version: 2.7.15 |Anaconda custom (64-bit)| (default, May 1 2018, 18:37:09) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)]
Architecture: 64bit
numpy: C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\lib\site-packages\numpy
numpy_version: 1.14.3
pandas: C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\lib\site-packages\pandas
python versions found:
C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\ANACON~1\python.exe
答案 0 :(得分:3)
我随心所欲地下载并安装了最新的RStudio桌面(1.2.701)并从1.1.442升级。这似乎解决了我的问题。包加载,我现在看到,当我运行py_config
时,我看到的路径反映了我的环境选择,正如我所料。
> py_config()
python: C:\Users\jal\AppData\Local\Continuum\Anaconda\envs\r-reticulate\python.exe
libpython: C:/Users/jal/AppData/Local/Continuum/Anaconda/envs/r-reticulate/python36.dll
pythonhome: C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1
version: 3.6.5 |Anaconda, Inc.| (default, Mar 29 2018, 13:32:41) [MSC v.1900 64 bit (AMD64)]
Architecture: 64bit
numpy: C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1\lib\site-packages\numpy
numpy_version: 1.14.3
psycopg2: C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1\lib\site-packages\psycopg2
python versions found:
C:\Users\jal\AppData\Local\Continuum\Anaconda\envs\r-reticulate\python.exe
C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\ANACON~1\python.exe
答案 1 :(得分:0)
我通过以下方式解决了我的问题:
$ open -na Rstudio
现在您有anac
答案 2 :(得分:0)
我在RStudio中通过以下方法解决了我的问题:
py_config() 找不到非系统安装的Python。 您要下载并安装Miniconda吗? Miniconda是用于Python的开源环境管理系统。 有关更多详细信息,请参见https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html。
您要安装Miniconda吗? [Y / n]:是
正在下载“ https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe” ... 尝试URL'https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe' 内容类型“应用程序/八位字节流”长度57256056字节(54.6 MB) 下载54.6 MB
正在安装Miniconda-请稍等...