如何将一个pbs的输出作为变量传递给另一个pbs脚本设置作业数组参数

时间:2018-06-07 13:21:20

标签: bash environment-variables job-scheduling pbs

我有一个PBS脚本(脚本A),它将确定我需要处理的样本数量 - 样本必须通过质量检查测试。

我有另一个PBS脚本(脚本B),它是一个作业数组脚本,用于批量处理大量样本。

是否可以将脚本A中确定的样本数作为变量传递给脚本B以设置作业数组参数,例如:#PBS -J 1-${samples_to_process}

(我正在使用-W depend将两个工作链接在一起。)

谢谢!

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