Question

我只需要解决我的RStudio问题。我和R＆amp; S都有最新的版本。 RStudio，但每次重新启动PC广告打开程序时它会告诉我没有安装某些软件包。几次后，我注意到有问题的包是：stringi，MASS，survival或Rcpp。

此外，如果我必须安装另一个依赖于它们的软件包，则会显示一条警告，说明所提到的软件包未更新，并且它为我提供了更新所有软件包的选项。

我尝试重新安装它们并在RStudio中作为管理员输入但没有任何作用，有没有人知道这里发生了什么？谢谢你的帮助。

Answer 1

R软件包安装在库中。由R搜索的库的位置由.libPaths()的值确定。你可能在多个库中安装了有问题的软件包;例如，检查dir(.libPaths()[1])和dir(.libPaths()[2])中安装的相同软件包。

使用remove.packages()和lib=参数删除一个安装。

我的做法是在默认库（可能是管理员）中安装R和基本软件包，并在我作为普通用户有权访问的库中安装所有其他软件包。个人库是.libPaths()中的第一个条目，它是软件包安装的默认位置。有关如何设置库的信息，请参阅?.libPaths;所有库路径都必须存在，否则R会默默地将它们从.libPaths()中删除。我在~/.Renviron中使用了一个设置。因此

> .libPaths()
[1] "/home/mtmorgan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5-Bioc-3.8"  # personal
[2] "/home/mtmorgan/bin/R-3-5-branch/library"                    # base
> sapply(.libPaths(), function(path) length(dir(path)))
/home/mtmorgan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5-Bioc-3.8 
                                                      236 
                  /home/mtmorgan/bin/R-3-5-branch/library 
                                                       30

始终重新安装包

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