Dicom文件存在对象检测问题

时间:2018-06-04 07:24:42

标签: object-detection dicom convolutional-neural-network

我遇到过在对象检测中使用dicom文件的问题。我需要识别CT(计算机断层扫描)图像上的各种物体。

我尝试按照本教程。作者使用jpeg文件标记数据集,获取具有图像上对象坐标的csv文件:

https://github.com/EdjeElectronics/TensorFlow-Object-Detection-API-Tutorial-Train-Multiple-Objects-Windows-10

我需要做的几乎一样,除了我没有jpegs,而是我有大量的dicom文件。我试图将它们转换为jpeg,但结果文件中存在质量损失。

我的问题是:

1)有没有什么好的方法可以将dicom文件转换成jpeg而不会造成大的质量损失?

2)有没有其他方法可以在dicom文件上进行对象检测?

提前致谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

Ad 1)质量损失取决于提取时应用于JPEG的压缩率。在图像分析方面,我会尝试避免(有损)压缩并使用像PNG这样的无损格式。

来自dcmtk的工具dcmj2pnm可能是您想要用来将DICOM文件转换为简单图像格式的工具。使用参数+ Jq,您可以控制压缩产生的质量(即信息丢失量)。同样的工具也可用于转换为其他格式(BMP,PNG)。

答案 1 :(得分:1)

您关注的教程使用OpenCV进行图像处理。因此,您不必将DICOM转换为jpg,而是直接使用DICOM像素数据:

在文件Object_detection_image.py中,而不是第92行:image = cv2.imread(PATH_TO_IMAGE)

import pydicom
ds = pydicom.dcmread(PATH_TO_DICOM_IMAGE)
image = ds.pixel_array