将错误栏添加到R中的水平条形图

Question

我非常感谢来自社区的小R问题的帮助。我到处搜索但还没有找到解决方案。

我的数据如下：

trait2 <- c('A','B','C','D')
rg <- c (0.5480, 0.4801, 0.2805, -0.2480)
se <- c(0.0495, 0.0908, 0.0548, 0.0957)

trait2   rg      se
A       0.5480  0.0495
B       0.4801  0.0908
C       0.2805  0.0548
D       -0.2480  0.0957

我用这段代码绘制了一个基本的条形图：

barplot1 <- barplot(data$rg,
main="correlation between traits",
xlab="rG",  
border="blue", 
las=1, 
horiz=TRUE, 
names.arg=data$trait2, 
cex.names=0.5,
xlim=range(-0.4,0.6,0.1) )

工作正常：

但我使用此代码时遇到错误栏的问题：

arrows(barplot1, 
   data$rg- data$se,
   data$rg+ data$se,
   lwd= 1.5,angle=90,code=3,length=0.05)

出现错误栏，但不显示它们应出现的位置：

这可能很简单，但如果有人可以帮助我，我会非常感激。 最好的，阿隆

Answer 1

如果horiz = FALSE，那么您的arrows代码块应为

arrows(x0 = barplot1, 
       y0 = data$rg - data$se,
       x1 = barplot1,
       y1 = data$rg + data$se,
       lwd= 1.5,angle=90,code=3,length=0.05)

但是，自horiz = TRUE起，您需要切换x0，y0，x1，y1的位置。在基础R中执行此操作的完整代码是：

barplot1 <- barplot(data$rg,
                    main="correlation between traits",
                    xlab="rG",  
                    border="blue", 
                    las=1, 
                    horiz = TRUE,
                    names.arg=data$trait2, 
                    cex.names=0.5,
                    xlim=range(-0.4,0.6,0.1))


segments(data$rg - data$se, barplot1, data$rg + data$se , barplot1,
         lwd = 1.5)

arrows(data$rg - data$se, barplot1, data$rg + data$se, barplot1, 
       lwd = 1.5, angle = 90,
       code = 3, length = 0.05)

在ggplot2中执行此操作会更容易。

ggplot(data, aes(trait2, rg)) + geom_col(color = "blue") + 
  geom_errorbar(aes(ymin = rg - se, ymax = rg + se), width = 0.3) + 
  coord_flip() + 
  theme_bw()