Question

我有一个方法来读取一个Newick文件并在Django框架中返回一个字符串，如下所示：

def handle_uploaded_file(f):
    output = " "
    for chunk in f.chunks():
        output += chunk.decode('ascii')
    return output.replace("\n", "").replace("\r", "")


def post(self, request):
    form = HomeForm(request.POST, request.FILES)
    if form.is_valid():
        input = handle_uploaded_file(request.FILES['file'])
        treeGelezen = Tree(input, format=1)
        script, div = mainmain(treeGelezen)
        form = HomeForm()
    args = {'form': form, 'script': script, 'div': div}
    return render(request, self.template_name, args)

哪个适用于普通的Newick文件，但我也有一些文件在文件开头有一个字符串。我正在尝试创建另一个方法来检查文件之前是否有以下字符串（在某些文件中就是这种情况）：“newick;”如果找到则删除字符串。它在本地工作，但我似乎无法合并它们。这是它在本地的样子：

def removeNewick(tree_with_newick):
    for x in tree_with_newick:
        if x.startswith('newick;'):
            print('')
    return x


filepath = "C:\\Users\\msi00\\Desktop\\ncbi-taxanomy.tre"
tree_with_newick = open(filepath)
tree = Tree(newick=removeNewick(tree_with_newick), format=1)

当我在python中指定路径时效果很好所以我尝试将它们组合在Django中，如下所示：

def handle_uploaded_file(f):
    tree_with_newick = open(f)
    for x in tree_with_newick:
        if x.startswith('newick;'):
            print('')
    return cutFile(x)


def cutFile(f):
    output = " "
    for chunk in f.chunks():
        output += chunk.decode('ascii')
    return output.replace("\n", "").replace("\r", "")


def post(self, request):
    form = HomeForm(request.POST, request.FILES)
    if form.is_valid():
        input = handle_uploaded_file(request.FILES['file'])
        treeGelezen = Tree(input, format=1)
        script, div = mainmain(treeGelezen)
        form = HomeForm()
    args = {'form': form, 'script': script, 'div': div}
    return render(request, self.template_name, args)

哪个不起作用，它会出现以下错误：

expected str, bytes or os.PathLike object, not InMemoryUploadedFile

我已经工作了两天了，无法弄清楚错误突然出现的原因。

Answer 1

错误正在发生，因为函数handle_uploaded_file(f)正在尝试打开已打开的文件。

request.FILES['file']的值是InMemoryUploadedFile，可以像普通文件一样使用。您无需再次打开它。

要修复，只需删除尝试打开文件的行：

def handle_uploaded_file(f):
    for x in f:
        if x.startswith('newick;'):
            print('')
    return cutFile(x)

Answer 2

在我的setting.py中，我有

MEDIA_ROOT = os.path.join(BASE_DIR, 'media'),

应该去的地方

MEDIA_ROOT = os.path.join(BASE_DIR, 'media')

为我解决了这个错误。

预期的str，bytes或os.PathLike对象，而不是InMemoryUploadedFile

2 个答案: