为什么pandas.series.map如此震撼?

时间:2018-05-31 23:00:00

标签: python pandas

有些日子我只是讨厌使用中间件。以此为例:我想要一个查找表,将一组输入(域)值中的值映射到输出(范围)值。映射是唯一的。 Python地图可以做到这一点,但由于地图非常大,我想,为什么不使用ps.Series及其索引,这增加了我可以的好处:

  • 传递多个值以映射为一系列(希望比字典查找更快)
  • 原始系列'索引在结果中维护
像这样:

domain2range = pd.Series(allrangevals, index=alldomainvals)
# Apply the map
query_vals = pd.Series(domainvals, index=someindex)
result = query_vals.map(domain2range)
assert result.index is someindex # Nice
assert (result.values in allrangevals).all() # Nice

按预期工作。但不是。以上.map的时间成本随着len(domain2range)的增加而增加(更明智地)O(len(query_vals)),如下所示:

numiter = 100
for n in [10, 1000, 1000000, 10000000,]:
    domain = np.arange(0, n)
    range = domain+10
    maptable = pd.Series(range, index=domain).sort_index()

    query_vals = pd.Series([1,2,3])
    def f():
        query_vals.map(maptable)
    print n, timeit.timeit(stmt=f, number=numiter)/numiter


10 0.000630810260773
1000 0.000978469848633
1000000 0.00130645036697
10000000 0.0162791204453

捂脸。在n = 10000000时,每个映射值采用(0.01 / 3)秒。

所以,问题:

  • Series.map预计会表现得像这样吗?为什么这么彻底,可笑得很慢?我认为我正在使用它,如文档中所示。
  • 有一种使用pandas进行表查找的快速方法。好像以上不是吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

https://github.com/pandas-dev/pandas/issues/21278

热身是个问题。 (double facepalm)。 Pandas在第一次使用时默默地构建和缓存哈希索引(O(maple))。调用测试函数并预先建立索引更好的性能。

numiter = 100
for n in [10, 100000, 1000000, 10000000,]:
    domain = np.arange(0, n)
    range = domain+10
    maptable = pd.Series(range, index=domain) #.sort_index()

    query_vals = pd.Series([1,2,3])

    def f1():
        query_vals.map(maptable)
    f1()
    print "Pandas1 ", n, timeit.timeit(stmt=f1, number=numiter)/numiter

    def f2():
        query_vals.map(maptable.get)
    f2()
    print "Pandas2 ", n, timeit.timeit(stmt=f2, number=numiter)/numiter

    maptabledict = maptable.to_dict()
    query_vals_list = pd.Series([1,2,3]).tolist()

    def f3():
        {k: maptabledict[k] for k in query_vals_list}
    f3()
    print "Py dict ", n, timeit.timeit(stmt=f3, number=numiter)/numiter
    print

pd.show_versions()
Pandas1  10 0.000621199607849
Pandas2  10 0.000686831474304
Py dict  10 2.0170211792e-05

Pandas1  100000 0.00149286031723
Pandas2  100000 0.00118808984756
Py dict  100000 8.47816467285e-06

Pandas1  1000000 0.000708899497986
Pandas2  1000000 0.000479419231415
Py dict  1000000 1.64794921875e-05

Pandas1  10000000 0.000798969268799
Pandas2  10000000 0.000410139560699
Py dict  10000000 1.47914886475e-05

...虽然有点令人沮丧的是python词典快了10倍。