如何在Bookdown

时间:2018-05-30 03:56:21

标签: r markdown bookdown

我希望在Bookdown中使用另一种书目风格而不是apalike,当我改变自然,这是数字风格,并建​​立了这本书,它促使我,

����: Failed to build the bibliography via bibtex
Please delete bookdown.Rmd after you finish debugging the error.
ִֹͣ��

Exited with status 1.

有解决方案吗? 标题作者和描述中有一些汉字,这是什么原因?

YAML标题

--- 
title: "title"
author: "aa"
date: "`r Sys.Date()`"
documentclass: ctexbook
bibliography: [book.bib]
biblio-style: nature
link-citations: yes
colorlinks: yes
lot: no
lof: no
geometry: [b5paper, tmargin=2.5cm, bmargin=2.5cm, lmargin=3.5cm, rmargin=2.5cm]
site: bookdown::bookdown_site
description: "dd。"
github-repo: yihui/bookdown-chinese
#cover-image: images/cover.jpg
---

会话:

R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=Chinese (Simplified)_China.936  LC_CTYPE=Chinese (Simplified)_China.936   
[3] LC_MONETARY=Chinese (Simplified)_China.936 LC_NUMERIC=C                              
[5] LC_TIME=Chinese (Simplified)_China.936    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] shiny_1.1.0

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.16     rstudioapi_0.7   xml2_1.2.0       knitr_1.20       magrittr_1.5     xtable_1.8-2    
 [7] R6_2.2.2         rlang_0.2.0      bibtex_0.4.2     plyr_1.8.4       httr_1.3.1       stringr_1.3.1   
[13] tools_3.5.0      xfun_0.1         miniUI_0.1.1     htmltools_0.3.6  yaml_2.1.19      assertthat_0.2.0
[19] rprojroot_1.3-2  digest_0.6.15    bookdown_0.7     RefManageR_1.2.0 later_0.7.2      promises_1.0.1  
[25] curl_3.2         evaluate_0.10.1  mime_0.5         rmarkdown_1.9    stringi_1.1.7    compiler_3.5.0  
[31] citr_0.2.0       backports_1.1.2  lubridate_1.7.4  jsonlite_1.5     httpuv_1.4.3    

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

  • https://www.zotero.org/styles?q=nature下载.csl文件 并将其复制到项目的根目录。
  • 在_output.yml citation_package: none
  • 中设置
  • 添加所有格式(gitbook,pdf_book, epout_book)在_output.yml中的行pandoc_args: [ "--csl", "your-csl-file.csl" ]
  • 在index.Rmd行biblio-style: apalike
  • 中删除或注释掉

请参阅完整程序use csl-file for pdf-output in bookdown

答案 1 :(得分:1)

您指定了bibtex样式nature.bst,但这在您的系统上不可用。我也无法在CTAN找到它。在CTAN上搜索有两件事:

所以要么使用

 biblio-style: naturemag

或(首选,见下文)使用

切换到biblatex
bookdown::pdf_book:
  citation_package: biblatex
_output.yml中的

。在这两种情况下,您都必须确保安装了所需的TeX软件包。这取决于TeX分布。在我的情况下(TeXLive为Debian打包)这意味着

sudo apt-get install texlive-publishers texlive-bibtex-extra

对于TeXLive本身或TinyTeX,您可以在命令行中使用:

tlmgr install nature
tlmgr install biblatex-nature

对于TinyTeX,您也可以在R:

中执行此操作
library(tinytex)
tlmgr_install('nature')
tlmgr_install('biblatex-nature')

有关详细信息,请参阅maintenance section

不幸的是,只有bbilatex解决方案与bookdown生成的默认引文命令兼容。人们可能会为引用更改插入LaTeX命令,但这会使其他格式变得更复杂。此外,biblatex是LaTeX中许多参考书目问题的“方法”...