Question

系统： Ubuntu 18.04

出现的原始错误促使我尝试重新安装R和依赖项：

Error: package or namespace load failed for 'lubridate' in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):  unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/stringi/libs/stringi.so':   libicui18n.so.57: cannot open shared object file: No such file or directory

重现的步骤：

安装R：apt install r-base
尝试安装R依赖项：install.packages(c("dplyr", "lubridate", "qcc", "forecast"), repos='http://cran.us.r-project.org')

安装期间显示的错误：

/usr/local/lib/R/site-library/BH/include/boost/smart_ptr/scoped_ptr.hpp:74:31: warning: 'template<class> class std::auto_ptr' is deprecated

安装后显示的错误：

The downloaded source packages are in
    '/tmp/RtmpnulsEe/downloaded_packages'
Warning message:
In install.packages(c("dplyr", "lubridate", "qcc", "forecast", "stringi"),  :
  installation of package 'forecast' had non-zero exit status

清除并重新安装r-base和R依赖项后，我看到了这一点......（已经检查过libcurl4-openssl-dev是最新版本）：

Error: package or namespace load failed for 'forecast' in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...): 
unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/curl/libs/curl.so':
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcurl.so.4: version `CURL_OPENSSL_3' not found (required by /usr/local/lib/R/site-library/curl/libs/curl.so)

更新：显然它是forecast库中的内容，因为我重现了这样的错误：

$ R
> library(forecast)
Error: package or namespace load failed for 'forecast' in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/curl/libs/curl.so':
  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcurl.so.4: version `CURL_OPENSSL_3' not found (required by /usr/local/lib/R/site-library/curl/libs/curl.so)

Answer 1

您最初的问题是stringi是根据libicu的发行版包版本构建的。由于此分发包不知道/ usr / local中有lubridate，因此它会更改并中断。

有很多方法可以解决这个问题。最简单（也是最窄的）是确保安装了libicu-dev。然后，您可以重新安装（即：重建stringi），然后加载lubridate。

对于其他人来说，你只是疯狂地扔掉一切可以移动到墙上的东西。您需要花点时间意识到您可以将所有这些安装为二进制文件（即来自启动板上的Michael Rutter PPA），或者来自源代码。你的来电。我有一个较旧的答案解释差异here（以及此处的其他后续内容），我们也帮助r-sig-debian列表。

但简而言之：阅读此README at CRAN（特别是前几段）并考虑PPA。

Answer 2

尝试以下操作后（在每个步骤之间清除并重新安装R）：

apt purge r-base
添加/删除了几个不同的PPA，然后才意识到它们都不支持Bionic Beaver。结果：Release not found。
找到Michael Rutter的PPA并试图使用它。结果：来自上方的相同错误消息（'CURL_OPENSSL_3' not found）。
尝试使用此SO article的多个解决方案。结果：来自上方的相同错误消息（'CURL_OPENSSL_3' not found）。

阅读this article并在R：

中执行以下操作

> remove.packages("curl")
> install.packages("curl")
> install.packages(c("dplyr", "lubridate", "qcc", "forecast", "stringi", "curl"), repos='http://cran.us.r-project.org')

一切都按预期运作。

在Ubuntu 18.04上安装新R之后安装R依赖项时出错

2 个答案: