WGCNA中的灰色模块是否有任何大小限制？

Question

WGCNA分析结果为我们提供了几个模块。这些模块是彩色的，也可以用数字编号。通常，数字中标记为0的灰色模块与未在任何模块中聚类的基因集相对应。我的确切问题是它的大小是否有任何限制，不应超过总数据的20％，或30％或50％？

Answer 1

我在其他地方收到了答案，所以我也在这里分享。

从support.bioconductor.org复制：

  

任何模块的大小或灰色的数量都没有限制   从WGCNA本身的角度来看基因。应该有多少基因   灰色最终取决于分析中有多少基因   开始以及如何过滤它们，分析师想要的选择性如何   在模块定义中 - 有些人更喜欢更紧凑的模块   只有高度相关的基因，其他人更喜欢分配尽可能多的基因   基因尽可能的模块。我不认为有“权利”或   “错误”的灰色基因数量，至少在不了解更多的情况下   关于如何进行分析。