Question

通过链接[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7128?report=xml&format=text][1]我检索了一种XML格式。从这种格式我检索了Gene-commentary_headings之间的所有信息。因此我使用了DOMDocuments和getElemenetsByTagName。现在，我正在尝试检索这条线;例如，名称为GeneOntology。 GeneOntology位于Gene-commmentary_heading的22标签上。我只检索位于Gene-commentary_headings部分内的信息。

<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<manifest android:hardwareAccelerated="true" android:versionCode="10000" android:versionName="1.0.0" package="com.hrh.crosswalk" xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android">
    <supports-screens android:anyDensity="true" android:largeScreens="true" android:normalScreens="true" android:resizeable="true" android:smallScreens="true" android:xlargeScreens="true" />
    <uses-permission android:name="android.permission.INTERNET" />
    <application android:hardwareAccelerated="true" android:icon="@mipmap/icon" android:label="@string/app_name" android:supportsRtl="true">
        <activity android:configChanges="orientation|keyboardHidden|keyboard|screenSize|locale" android:label="@string/activity_name" android:launchMode="singleTop" android:name="MainActivity" android:theme="@android:style/Theme.DeviceDefault.NoActionBar" android:windowSoftInputMode="adjustResize">
            <intent-filter android:label="@string/launcher_name">
                <action android:name="android.intent.action.MAIN" />
                <category android:name="android.intent.category.LAUNCHER" />
            </intent-filter>
        </activity>
    </application>
    <uses-sdk android:minSdkVersion="16" android:targetSdkVersion="26" />
    <uses-permission android:name="android.permission.ACCESS_NETWORK_STATE" />
    <uses-permission android:name="android.permission.ACCESS_WIFI_STATE" />
    <uses-permission android:name="android.permission.CAMERA" />
    <uses-permission android:name="android.permission.MICROPHONE" />
    <uses-permission android:name="android.permission.RECORD_AUDIO" />
    <uses-permission android:name="android.permission.MODIFY_AUDIO_SETTINGS" />
    <uses-permission android:name="android.permission.WAKE_LOCK" />
</manifest>

现在，我正在尝试打印所有名称为Other-source_anchor的标签。例如

InAppBrowser.open("https://appr.tc/r/123", "_blank", "location=no")

但是在GOA上也有相同的标签但是更高级别。我只想在DNA结合水平检索标签。如果我使用

<Gene-commentary_heading>GeneOntology</Gene-commentary_heading>.

我没有结果。如果我用$ doc更改$ node，我会检索带有标记的所有nodeValues。如何确保我只检索DNA绑定级别的Other-source_anchor标记的nodeValues？

贝娄是我写的代码：

<Other-source_anchor>DNA binding</Other-source_anchor>

我在上面的代码中使用的部分xml文件。

foreach($node->getElementsByTagName('Other-source_anchor') as $subnode)

Answer 1

功能

以字符串格式检索给定路径的信息的函数

function xml_retriever($xml_link,$path){
    $result = file_get_contents($xml_link);
    $xml = simplexml_load_string($result);
    $doc = new DOMDocument();
    $doc = DOMDocument::loadXML($xml);
    $xpath = new DOMXPath($doc);
    $entries = $xpath->query($path);
    $attr = '';
    foreach($entries as $node){
        $attr .= '|'.' '.$node->nodeValue. "\r\n";
        $attr = ltrim($attr, '|');
    }
    return $attr;
}

功能测试

如果函数有效，可以进行简单测试

# Example query and example path
$esearch_test = "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7128?report=xml&format=text";
$query = "/Entrezgene/Entrezgene_properties/Gene-commentary[3]/Gene-commentary_comment/Gene-commentary[1]/Gene-commentary_comment/Gene-commentary[*]/Gene-commentary_source/Other-source/Other-source_anchor";
# Print the result
echo xml_retriever($esearch_test,$query);

如何使用相同的标记名称（在不同级别）和不同的值打印nodeValue？

1 个答案:

功能

功能测试