Sci-kit学习如何打印混淆矩阵的标签?

时间:2018-05-14 08:14:49

标签: python machine-learning scikit-learn confusion-matrix

所以我使用sci-kit学习分类一些数据。我有13个不同的类值/分类来分类数据。现在我已经能够使用交叉验证并打印混淆矩阵。但是,它只显示没有类标签的TP和FP等,所以我不知道哪个类是什么。下面是我的代码和输出:

def classify_data(df, feature_cols, file):
    nbr_folds = 5
    RANDOM_STATE = 0
    attributes = df.loc[:, feature_cols]  # Also known as x
    class_label = df['task']  # Class label, also known as y.
    file.write("\nFeatures used: ")
    for feature in feature_cols:
        file.write(feature + ",")
    print("Features used", feature_cols)

    sampler = RandomOverSampler(random_state=RANDOM_STATE)
    print("RandomForest")
    file.write("\nRandomForest")
    rfc = RandomForestClassifier(max_depth=2, random_state=RANDOM_STATE)
    pipeline = make_pipeline(sampler, rfc)
    class_label_predicted = cross_val_predict(pipeline, attributes, class_label, cv=nbr_folds)
    conf_mat = confusion_matrix(class_label, class_label_predicted)
    print(conf_mat)
    accuracy = accuracy_score(class_label, class_label_predicted)
    print("Rows classified: " + str(len(class_label_predicted)))
    print("Accuracy: {0:.3f}%\n".format(accuracy * 100))
    file.write("\nClassifier settings:" + str(pipeline) + "\n")
    file.write("\nRows classified: " + str(len(class_label_predicted)))
    file.write("\nAccuracy: {0:.3f}%\n".format(accuracy * 100))
    file.writelines('\t'.join(str(j) for j in i) + '\n' for i in conf_mat)

#Output
Rows classified: 23504
Accuracy: 17.925%
0   372 46  88  5   73  0   536 44  317 0   200 127
0   501 29  85  0   136 0   655 9   154 0   172 67
0   97  141 78  1   56  0   336 37  429 0   435 198
0   135 74  416 5   37  0   507 19  323 0   128 164
0   247 72  145 12  64  0   424 21  296 0   304 223
0   190 41  36  0   178 0   984 29  196 0   111 43
0   218 13  71  7   52  0   917 139 177 0   111 103
0   215 30  84  3   71  0   1175    11  55  0   102 62
0   257 55  156 1   13  0   322 184 463 0   197 160
0   188 36  104 2   34  0   313 99  827 0   69  136
0   281 80  111 22  16  0   494 19  261 0   313 211
0   207 66  87  18  58  0   489 23  157 0   464 239
0   113 114 44  6   51  0   389 30  408 0   338 315

正如您所看到的,您无法真正了解哪些列是什么,并且打印件也是"未对齐"所以很难理解。

有没有办法打印标签?

5 个答案:

答案 0 :(得分:7)

doc开始,似乎没有这样的选项来打印混淆矩阵的行和列标签。但是,您可以使用参数labels=...

指定标签顺序

示例:

from sklearn.metrics import confusion_matrix

y_true = ['yes','yes','yes','no','no','no']
y_pred = ['yes','no','no','no','no','no']
print(confusion_matrix(y_true, y_pred))
# Output:
# [[3 0]
#  [2 1]]
print(confusion_matrix(y_true, y_pred, labels=['yes', 'no']))
# Output:
# [[1 2]
#  [0 3]]

如果您想使用标签打印混淆矩阵,可以尝试pandas并设置index的{​​{1}}和columns

DataFrame

或者

import pandas as pd

print(pd.DataFrame(confusion_matrix(y_true, y_pred, labels=['yes', 'no']), index=['true:yes', 'true:no'], columns=['pred:yes', 'pred:no']))
# Output:
#           pred:yes  pred:no
# true:yes         1        2
# true:no          0        3

答案 1 :(得分:0)

您的数据似乎有13个不同的类,这就是您的混淆矩阵有13行和列的原因。此外,你的课程没有任何标签,只有我能看到的整数。

如果不是这种情况,并且您的训练数据有实际标签,您可以将唯一标签列表传递给confusion_matrix

conf_mat = confusion_matrix(class_label, class_label_predicted, df['task'].unique())

答案 2 :(得分:0)

由于混淆矩阵只是一个numpy矩阵,因此它不包含任何列信息。您可以做的是将矩阵转换为数据帧,然后打印此数据帧。

  select * from `table` where `col1` = 'x' and `col2` = 'y' and `col3` = 'z' 

代码段来自https://gist.github.com/nickynicolson/202fe765c99af49acb20ea9f77b6255e

输出:

import pandas as pd
import numpy as np

def cm2df(cm, labels):
    df = pd.DataFrame()
    # rows
    for i, row_label in enumerate(labels):
        rowdata={}
        # columns
        for j, col_label in enumerate(labels): 
            rowdata[col_label]=cm[i,j]
        df = df.append(pd.DataFrame.from_dict({row_label:rowdata}, orient='index'))
    return df[labels]

cm = np.arange(9).reshape((3, 3))
df = cm2df(cm, ["a", "b", "c"])
print(df)

答案 3 :(得分:0)

确保标记混淆矩阵行和列的方式与sklearn对类的编码方式完全一致非常重要。可以使用分类器的.classes_属性显示标签的真实顺序。您可以使用以下代码准备混淆矩阵数据框。

labels = rfc.classes_
conf_df = pd.DataFrame(confusion_matrix(class_label, class_label_predicted, columns=labels, index=labels))
conf_df.index.name = 'True labels'

要注意的第二件事是你的分类器不能很好地预测标签。正确预测的标签的数量显示在混淆矩阵的主对角线上。您在矩阵中有非零值,并且根本没有预测某些类 - 全部为零的列。使用默认参数运行分类器然后尝试优化它们可能是个好主意。

答案 4 :(得分:0)

另一种更好的方法是在熊猫中使用交叉表功能。

pd.crosstab(y_true,y_pred,行名= ['True'],列名= ['Predicted'],margins = True)。

pd.crosstab(le.inverse_transform(y_true),le.inverse_transform(y_pred),rownames = ['True'],colnames = ['Predicted'],margins = True)