将conda安装与在read-the-docs中运行setup.py相结合

时间:2018-05-10 11:27:25

标签: python python-sphinx conda setup.py read-the-docs

我正在尝试添加阅读文档以查看我们的github托管项目的文档。该项目是Calour - 用于微生物组实验的交互式热图分析程序。

我们对项目有很多要求 - 有些是conda可安装的(比如numpy,scipy等),有些需要pip安装。

对于sphinx文档,我们需要导入calour模块本身,这取决于所有这些依赖项。

使用readthedocs.yml中的conda:部分,我们设法安装conda和pip依赖项,但是,当我们尝试使用python部分" python.setup_py_install:true & #34;标志,读取文档不会创建conda环境,而是创建一个没有conda安装的虚拟环境。

有没有办法在conda环境中运行setup.py?

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