Question

我正在尝试安装libpca软件包。我已经安装了犰狳。

libpca包解压缩到/my/dir/。我将CPLUS_INCLUDE_PATH和其他变量设置为Armadillo安装的位置。（export CPLUS_INCLUDE_PATH=/my/dir/arma_install/include/:$CPLUS_INCLUDE_PATH）

我运行以下命令来安装libpca：

/my/dir/libpca-1.3.3$  ./configure --prefix=/my/dir/libpca-1.3.3
/my/dir/libpca-1.3.3$  make

有警告但没有错误。命令：

/my/dir/libpca-1.3.3$  make install prefix=/my/dir/libpca-1.3.3

看起来很好，并且没有报告错误。

然后我尝试在/my/dir/libpca-1.3.3/examples/simple/pca_example.cpp中编译并运行示例文件。在dir examples中，我运行

/my/dir/libpca-1.3.3/examples$  make

返回

make [1]：没有什么可以做的＆＃39;所有＆＃39;

make [1]：没有什么可以做的，所有的＆＃39;

并且没有创建新文件。然后我进入examples/simple，然后运行

/my/dir/libpca-1.3.3/examples/simple$  make

它返回：

make：没有什么可以为所有＆＃39;
做的

并且没有创建新文件。然后我跑

/my/dir/libpca-1.3.3/examples/simple$  make check

它返回以下错误：

上述错误中的变量wrapper_dsyev_，wrapper_dgemv_，wrapper_dgemm_等存在于以下二进制文件中：

/my/dir/arma_install/lib64/libarmadillo.so.8.500.0
/my/dir/arma_downloaded/CMakeFiles/armadillo.dir/src/wrapper.cpp.o
/my/dir/arma_downloaded/CMakeFiles/CMakeRelink.dir/libarmadillo.so.8.500.0

我export进入LD_LIBRARY_PATH后，仍会返回相同的错误。

我认为包含路径和环境变量应该有问题。我该如何解决？

此外，如果我需要在/my/dir/working_dir/中编写代码，我该如何设置路径？

----------------------------------编辑如下----------- ---------

当我进行下述更新时，请执行步骤3：

/my/dir/libpca-1.3.3$ LD_LIBRARY_PATH=/my/dir/arma_install/lib64 make check

它返回以下错误：

LD_LIBRARY_PATH = / my / dir / arma_install / lib64 / make check

在src / lib中进行检查

make [1]：输入目录`/my/dir/libpca-1.3.3/src/lib'

make [1]：离开目录`/my/dir/libpca-1.3.3/src/lib'

进行检查

make [1]：进入目录`/my/dir/libpca-1.3.3/test'

make unittest

make [2]：进入目录`/my/dir/libpca-1.3.3/test'

/ bin / sh ../libtool --tag = CXX --mode = link g ++ -I ../ src / lib
  -pthread -O2 -o unittest main.o testcases.o test_pca.o test_utils.o ../src/lib/.libs/libpca.a -L / my / dir / source_scripts / lib64

libtool：link：g ++ -I ../ src / lib -pthread -O2 -o unittest main.o   testcases.o test_pca.o test_utils.o ../src/lib/.libs/libpca.a   -L / my / dir / arma_install / lib64 -pthread

test_utils.o：在函数`void arma :: glue_times :: apply，arma :: Mat


（arma :: Mat＆amp;，arma :: Mat const＆amp;，arma :: Mat const＆amp;，double）＆＃39;：


test_utils.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb1ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb1ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x169）：   对'wrapper_dgemm _＆＃39;
的未定义引用
test_utils.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb1ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb1ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x363）：   对'wrapper_dgemv _＆＃39;
的未定义引用
test_utils.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb1ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb1ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x45c）：   未定义的引用`wrapper_dsyrk _＆＃39;

../ src / lib / .libs / libpca.a（pca.o）：在功能上   `统计:: PCA :: bootstrap_eigenvalues _（）＆＃39;：

pca.cpp :(。text + 0x454d）：对`wrapper_dsyev _＆＃39;
的未定义引用
pca.cpp :(。text + 0x4953）：对`wrapper_dsyevd _＆＃39;
的未定义引用
../ src / lib / .libs / libpca.a（pca.o）：在函数`bool中   ARMA :: auxlib :: eig_sym_dc


（arma :: Col＆amp;，arma :: Mat＆amp;，arma :: Base＆gt; const＆amp;）＆＃39;：


pca.cpp :( text._ZN4arma6auxlib10eig_sym_dcIdNS_3MatIdEEEEbRNS_3ColIT_EERNS2_IS5_EERKNS_4BaseIS5_T0_EE [_ZN4arma6auxlib10eig_sym_dcIdNS_3MatIdEEEEbRNS_3ColIT_EERNS2_IS5_EERKNS_4BaseIS5_T0_EE] + 0x13a）：   对`wrapper_dsyevd _＆＃39;
的未定义引用
../ src / lib / .libs / libpca.a（pca.o）：在函数`bool中   ARMA :: eig_sym


（arma :: Col :: pod_type＆gt;＆amp;，arma :: Mat :: elem_type＆gt;＆amp;，     arma :: Base :: elem_type，arma :: Mat＆gt;常量和放大器;，     char const *，     ARMA :: arma_blas_type_only :: elem_type＆GT; ::结果     常量*）＆＃39;：


pca.cpp :( text._ZN4arma7eig_symINS_3MatIdEEEEbRNS_3ColINT_8pod_typeEEERNS1_INS4_9elem_typeEEERKNS_4BaseIS8_S4_EEPKcPKNS_19arma_blas_type_onlyIS8_E6resultE [_ZN4arma7eig_symINS_3MatIdEEEEbRNS_3ColINT_8pod_typeEEERNS1_INS4_9elem_typeEEERKNS_4BaseIS8_S4_EEPKcPKNS_19arma_blas_type_onlyIS8_E6resultE] +量0x1A0）：   未定义的引用`wrapper_dsyev _＆＃39;

../ src / lib / .libs / libpca.a（pca.o）：在函数`double中   arma :: auxlib :: det_lapack（arma :: Mat const＆amp;，bool）＆＃39;：

pca.cpp :( text._ZN4arma6auxlib10det_lapackIdEET_RKNS_3MatIS2_EEb [_ZN4arma6auxlib10det_lapackIdEET_RKNS_3MatIS2_EEb] + 0x117）：   对'wrapper_dgetrf _＆＃39;
的未定义引用
../ src / lib / .libs / libpca.a（pca.o）：在函数`void arma :: gemv :: apply_blas_type＆gt;（double *，   arma :: Mat const＆amp;，double const *，double，double）＆＃39;：

pca.cpp :( text._ZN4arma4gemvILb1ELb0ELb0EE15apply_blas_typeIdNS_3MatIdEEEEvPT_RKT0_PKS5_S5_S5 _ [_ _ ZN4arma4gemvILb1ELb0ELb0EE15apply_blas_typeIdNS_3MatIdEEEEvPT_RKT0_PKS5_S5_S5] + 0x86可以）：   对'wrapper_dgemv _＆＃39;
的未定义引用
../ src / lib / .libs / libpca.a（pca.o）：在函数`void arma :: gemv :: apply_blas_type＆gt;（double *，   arma :: Mat const＆amp;，double const *，double，double）＆＃39;：

pca.cpp :( text._ZN4arma4gemvILb0ELb0ELb0EE15apply_blas_typeIdNS_3MatIdEEEEvPT_RKT0_PKS5_S5_S5 _ [_ _ ZN4arma4gemvILb0ELb0ELb0EE15apply_blas_typeIdNS_3MatIdEEEEvPT_RKT0_PKS5_S5_S5] + 0x86可以）：   对'wrapper_dgemv _＆＃39;
的未定义引用
../ src / lib / .libs / libpca.a（pca.o）：在函数`void   arma :: glue_times :: apply，arma :: Mat＆gt;（arma :: Mat＆amp ;,,   arma :: Mat const＆amp;，arma :: Mat const＆amp;，double）＆＃39;：

pca.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb0ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb0ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x129）：   对'wrapper_dgemm _＆＃39;
的未定义引用
pca.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb0ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb0ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x334）：   对'wrapper_dgemv _＆＃39;
的未定义引用
../ src / lib / .libs / libpca.a（pca.o）：在函数`void   ARMA :: glue_times ::申请，   arma :: Mat＆gt;（arma :: Mat＆amp;，arma :: Mat const＆amp ;,,   arma :: Mat const＆amp;，double）＆＃39;：

pca.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb0ELb1ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb0ELb1ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x14a）：   对'wrapper_dgemm _＆＃39;
的未定义引用
pca.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb0ELb1ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb0ELb1ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x33c）：   未定义的引用`wrapper_dsyrk _＆＃39;

../ src / lib / .libs / libpca.a（utils.o）：在函数中   `stats :: utils :: compute_column_rms（arma :: Mat const＆amp;）＆＃39;：

utils.cpp :(。text + 0xe95）：对`wrapper_ddot _＆＃39;
的未定义引用
../ src / lib / .libs / libpca.a（utils.o）：在函数`void   ARMA :: glue_times ::申请，   arma :: Mat＆gt;（arma :: Mat＆amp;，arma :: Mat const＆amp ;,,   arma :: Mat const＆amp;，double）＆＃39;：

utils.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x353）：   对'wrapper_dgemm _＆＃39;
的未定义引用
utils.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x8a4）：   对'wrapper_dgemv _＆＃39;
的未定义引用
utils.cpp :( text.hot._ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4 _ [_ _ ZN4arma10glue_times5applyIdLb1ELb0ELb0ENS_3MatIdEES3_EEvRNS2_IT_EERKT3_RKT4_S4] + 0x9ab）：   未定义的引用`wrapper_dsyrk _＆＃39;

collect2：错误：ld返回1退出状态

make [2]：*** [unittest]错误1

make [2]：离开目录`/my/dir/libpca-1.3.3/test'

make [1]：*** [check-am]错误2

make [1]：离开目录`/my/dir/libpca-1.3.3/test'

make：*** [check-recursive]错误1

接下来我该怎么做？

Answer 1

您需要告诉链接器您的犰狳库的位置。您可以通过两种方式实现这一目标：

通过环境变量：export LIBRARY_PATH=/arma/lib:$LIBRARY_PATH
通过armadillo include和库路径直接配置： ./configure --with-armadillo-incdir=/arma/include --with-armadillo-libdir=/arma/lib

我建议使用选项2，因为它可以防止设置额外的环境变量，这些变量可能会污染您的环境。

请注意，--prefix表示安装libpca的目录。这应该与源目录不同！

配置完成后，您可以投放make，make check和make install。要使make check成功，linux库加载器需要知道armadillo共享库的位置。因此，一个选项就是这样运行：LD_LIBRARY_PATH=/arma/lib make check

总结您需要运行的命令：

./configure --prefix=/libpca/install --with-armadillo-incdir=/arma/include --with-armadillo-libdir=/arma/lib
make
LD_LIBRARY_PATH=/arma/lib make check
make install

显然，您需要根据自己的情况调整路径。

警告：在某些平台上，您需要显式链接lapack和blas。因此，如果您遇到更多链接器错误，请尝试像这样配置： LIBS='-llapack -lblas' ./configure --prefix=/libpca/install --with-armadillo-incdir=/arma/include --with-armadillo-libdir=/arma/lib

无法在libpca

1 个答案: