使用--enable-R-shlib安装R 3.5.0

时间:2018-05-02 13:07:16

标签: r ubuntu gcc makefile linuxmint

我正在尝试使用Linux Mint下的标志--enable-R-shlib从源安装R 3.5.0。在没有标志的情况下配置和安装它可以正常工作,但是RStudio需要设置标志。但是,在运行时

./configure --enable-R-shlib
make

我收到错误

/usr/bin/ld: CommandLineArgs.o: relocation R_X86_64_32 against `.rodata.str1.1' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC
CommandLineArgs.o: error adding symbols: Bad value
collect2: error: ld returned 1 exit status
Makefile:177: recipe for target 'libR.so' failed
make[3]: *** [libR.so] Error 1
make[3]: Leaving directory '/home/hps/Downloads/R-3.5.0/src/main'
Makefile:135: recipe for target 'R' failed
make[2]: *** [R] Error 2
make[2]: Leaving directory '/home/hps/Downloads/R-3.5.0/src/main'
Makefile:28: recipe for target 'R' failed
make[1]: *** [R] Error 1
make[1]: Leaving directory '/home/hps/Downloads/R-3.5.0/src'
Makefile:60: recipe for target 'R' failed
make: *** [R] Error 1

我尝试按照[1]

的建议设置错误消息中提到的-fPIC标志
CC="gcc -fPIC" ./configure --enable-R-shlib

无济于事,我仍然收到相同的错误消息。

[1] Passing a gcc flag through makefile

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

PPAs添加这些Ubuntu后,我能够为我的Linux Mint 17.3 Rosa将R更新为3.5.0

sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter3.5
sudo add-apt-repository ppa:marutter/c2d4u
sudo apt-get update

参考:https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/

编辑:要从源代码编译,请按照建议here

进行操作
sudo apt-get update
sudo apt-get build-dep r-base
wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.5.0.tar.gz
tar -xvf R-3.5.0.tar.gz
cd R-3.5.0
./configure --enable-R-shlib
make

答案 1 :(得分:1)

以防万一其他人遇到这个问题。

问题是目标文件“.o”已经在没有 -fpic 选项的情况下编译。

正确的解决方案是从第一次构建中删除目标文件并重新编译:

make clean
./configure --enable-R-shlib
make -j 4

sudo make install

-j 4 告诉 make 一次产生四个编译进程。调整数量以匹配处理器内核数。