Question

过去几个月我一直在学习R Markdown。让Anaconda Python在R Markdown脚本中运行相当容易，但我还没有找到一种方法来在同一个文档中运行大块的bash代码。

使用

```{bash}
echo hello world
```

我收到错误消息

/ bin / bash：C：\ Users \ MyName \ AppData \ Local \ Temp \ Rtmp0MpNfS \ chunk-code-4cbc213a3545.txt：没有这样的文件或目录

你们中间有谁可能知道这个问题的根源是什么？

Answer 1

我知道可能要晚了，但是我遇到了同样的问题，我找到了解决方法。

首先，在Windows 8.1中，或者如果您没有Windows Linux子系统（WSL），则可以安装 Cygwin ： https://cygwin.com/>安装Cygwin < / em>

这是 R Markdown：权威指南（https://bookdown.org/yihui/rmarkdown/）> 2.7其他语言引擎> 2.7.2 Shell脚本
中指出的建议。

第二，将Cygwin添加到PATH。通常，Cygwin安装在C:\cygwin64中，在这种情况下，包含路径将为C:\cygwin64\bin

第三，使用R中的base::Sys.which("bash")检查一切正确

如果一切正确，它将显示以下内容"C:\\cygwin64\\bin\\bash.exe"

第四，您可以在Rmarkdown文档中运行，您已指出要仔细检查的块：

```{bash} echo hello world ```

有没有一种简单的方法可以使用Windows 10在R Markdown上运行bash脚本？

1 个答案: