在R中索引列名

时间:2018-05-01 10:38:07

标签: r indexing

我有一个如下数据框,

    > df
  A B C D E
1 1 2 3 4 5
2 4 5 6 7 7
3 7 8 9 8 9

其中行是Genes,Column是Sample Ids,我想索引正常/疾病样本。正常样品是A,B,疾病样品是D& E(例如)。我有一个Phenotypic文件如下

> Pheno
      sample status
    1 A         Normal
    2 B         Normal
    3 C         Unknown
    4 D         Diseased
    5 E         Diseased

现在我的问题是如何在' df'中对样本进行索引,例如,对于正常情况,== 0,对于基于Pheno文件分类的疾病在R中,= = 1。 (从RNAseq原始计数文件中将样本转化为正常和患病。将758个样本作为列,将556789个基因作为行进行索引)希望我很清楚,如果你可以帮助我,那就太棒了。非常感谢你的帮助

此致

祝你有个美好的一天,

戴夫。

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