Question

我有一个输入列表，我把它转换成一个字符串，所以我可以用于我的主程序（DNA翻译），为此我需要它的长度来找到3个不同的帧。顺便说一下，它需要提到用户输入了一个输入（DNA序列，例如ATGCGTAGT）。

我转换我的comp seq的第一部分是：

comp = {'A': 'T', 'T': 'A', 'C': 'G', 'G': 'C' }

for i in sequence_list :
    comp_sequence += comp[i]

reversed_comp_seq = ''.join(reversed(comp_sequence))

稍后，在我的程序中，它在这里使用：

for e in range(0, len(reversed_comp_seq)-len(reversed_comp_seq)%3,3):
    Frame4 += codons1[reversed_comp_seq[e:e + 3]]
    print(Frame4)

然后我无法运行它来找到反向翻译，因为它说明了这一点：

TypeError: object of type 'reversed' has no len()

你能帮帮我吗？谢谢！

Answer 1

你的问题有点不清楚，但如果你想做的就是翻译和逆转你能做的DNA序列：

comp = {'A': 'T', 'T': 'A', 'C': 'G', 'G': 'C' }

s = 'GATACA'
s_comp = s.translate(s.maketrans(comp))
s_comp_reversed = s_comp[::-1]

或者一次完成所有操作：

def complement_reversed(seq):
    return seq.translate(s.maketrans(comp))[::-1]

错误：类型＆＃39;反转的对象＆＃39;没有len（）？

1 个答案: