使用HBase和Parquet,我编写了代码来从HBase获取值并将值映射到Object类,但是我无法使用数据集对Parquet进行复制。
HBase的:
JavaPairRDD<ImmutableBytesWritable, Result> data = sc.newAPIHadoopRDD(getHbaseConf(),
TableInputFormat.class, ImmutableBytesWritable.class, Result.class);
JavaRDD<List<Tuple3<Long, Integer, Double>>> tempData = data
.values()
//Uses HBaseResultToSimple... class to parse the data.
.map(value -> {
SimpleObject object = oParser.call(value);
// Get the sample property, remove leading and ending spaces and split it by comma
// to get each sample individually
List<Tuple2<String, Integer>> samples = zipWithIndex((object.getSamples().trim().split(",")));
// Gets the unique identifier for that sp.
Long sp = object.getPos();
// Calculates the hamming distance for this sp for each sample.
// i.e. 0|0 => 0, 0|1 => 1, 1|0 => 1, 1|1 => 2
return samples.stream().map(t -> {
String alleles = t._1();
Integer patient = t._2();
List<String> values = Arrays.asList(alleles.split("\\|"));
Double firstA = Double.parseDouble(values.get(0));
Double second = Double.parseDouble(values.get(1));
// Returns the initial sp id, p id and the distance in form of Tuple.
return new Tuple3<>(snp, patient, firstAllele + secondAllele);
}).collect(Collectors.toList());
});
我将Parquet中的数据读入数据集,但简单无法复制上述方法。
Dataset<Row> url = session.read().parquet(fileName);
我只需要知道如何将Dataset<Row>
中的行映射到对象类,就像我在上面的方法中使用.map(value -> {...
一样。
任何帮助将不胜感激。
答案 0 :(得分:1)
选项1:将您的数据框(又名Dataset<Row>
)转换为类型化数据集。假设类Data
是一个适合镶木地板文件结构的简单Java bean,您可以使用:
Dataset<Data> ds = inputDf.as(Encoders.bean(Data.class));
在此数据集上,您可以使用具有键入访问权限的地图功能:
Dataset<String> ds2 = ds.map( d -> d.getA(), Encoders.STRING());
(在这个例子中,我假设类Data
有一个名为A
的属性为String的属性。)
选项2:另一个不需要额外课程的选项就是直接在地图调用中使用Row对象:
Dataset<String> ds3 = inputDf.map(r -> r.getString(0), Encoders.STRING());
(同样,我假设第一列是一个字符串。)