我正在尝试使用ggplot2在多个图表上添加p值，并且它运行良好（图1），直到我尝试使用scales =“free”。当我添加免费比例时，它会收到Warning messages:
1: Computation failed in stat_compare_means(:
group1, p must resolve to integer column positions, not NULL
我的数据框：
> burst.data
Host Clade Phage Burst.Size
1 CC9605 A S-TIP28 20
2 CC9605 A S-TIP28 25
3 CC9605 A S-TIP28 38
4 CC9605 A S-TIP28 44
5 CC9605 A S-TIP28 56
6 CC9605 A S-TIP28 56
7 CC9605 A S-TIP28 59
8 CC9605 A S-TIP28 61
没有比例的代码=免费：
ggplot(burst.data, aes(Phage, Burst.Size,fill=Clade))+
geom_boxplot(width=0.75,outlier.size=5,size=1.5)+
facet_wrap( ~ Host,nrow = 1)+
stat_compare_means( )
图像： enter image description here
但当我尝试使用scale =“free”仅显示每个图的相关数据时 stat_compare_means（）重新发出warnig，而不是将p值添加到图中：
> ggplot(burst.data, aes(Phage, Burst.Size,fill=Clade))+
+ geom_boxplot()+
+ facet_wrap( ~ Host,scales = "free",nrow = 1)+
+ stat_compare_means( )
Warning messages:
1: Computation failed in `stat_compare_means()`:
`group1`, `p` must resolve to integer column positions, not NULL
2: Computation failed in `stat_compare_means()`:
`group1`, `p` must resolve to integer column positions, not NULL
3: Computation failed in `stat_compare_means()`:
`group1`, `p` must resolve to integer column positions, not NULL
