在bash中调整列填充

Question

知道如何将输出设为以下内容？

输入：

     1 GATTT
     2 ATCGT

期望的输出：

1      GATTT
2      ATCGT

我尝试了以下内容并且无效

cut -c7,1-6,8-

Answer 1

$ awk -v OFS='\t' '{print $1,$2}' input

1       GATTT
2       ATCGT

或

$ awk '{print $1 "\t" $2}' input

Answer 2

也可以使用SED：

sed  "s/[:digit:]* .*/    &/g" input

1    GATTT
2    ATCGT

Answer 3

我假设原始空白是基于你的剪切命令的6个空格。使用简单的bash命令解决这个问题的最简单方法是在输出上使用选项卡进行分离。

echo "      1 GATTT" | cut -d ' ' -f 7- | tr ' ' '\t'

cut命令使分隔符成为空格字符，并从字段7开始。然后tr（translate）命令将剩余空间转换为选项卡。