R Markdown / knitr：指定所有输入，临时和输出文件的路径

Question

我想让R Markdown和knitr在限制访问的linux服务器上工作。特别是：特定文件类型必须进入特定文件夹并且无法创建新文件夹。也无法删除文件（但覆盖是）。 R Markdown和knitr似乎想创建一系列文件和文件夹，控制有限。似乎有一些方法可以在块的基础上对块进行规范，但是如果没有大量的用户培训，这将无法工作。是否可以为所有输入和输出指定单独的路径，包括：

• 输入文档（可以使用rmarkdown :: render（））
设置
• 由块创建的数字（不能使用rmarkdown :: render（））
设置
• *。md，*。tex，* .aux和其他中间文件（可以使用rmarkdown :: render（）设置）
• *。日志文件（不能使用rmarkdown :: render（））
设置
• 最终输出文件（例如PDF）（可以使用rmarkdown :: render（））
设置

理想情况下，该解决方案应该适用于R Studio和基本R，但欢迎使用部分解决方案。