从输入文件中grep某个列

Question

我有一个文件file1.txt，其格式如下：

EMERGE-3 16218877 0 0 2 -9
EMERGE-3 16230920 0 0 1 -9
EMERGE-8 16220003 0 0 1 -9
EMERGE-9 16231695 16220014 16220010 1 -9
EMERGE-11 16218001 0 0 1 -9

我有另一个文件file2.txt，其中的ID列表如下：

16230920
16220014
16218001
16218877

我想仅在file1.txt的第2列执行grep搜索。因此，搜索的输出将类似于：

somecommand file1 file2

EMERGE-3 16230920 0 0 1 -9
EMERGE-11 16218001 0 0 1 -9
EMERGE-3 16218877 0 0 2 -9

（请注意，行EMERGE-9 16231695 16220014 16220010 1 -9未包含在输出中）。这是我现在面临的主要问题。如果我执行命令：

grep -f file2.txt file1.txt

输出将包含行EMERGE-9 16231695 16220014 16220010 1 -9，因为ID 16220014位于file1.txt的第3列，但我试图避免在输出中包含此行 - 即我只想要在file1.txt的第2列中搜索ID。

Answer 1

关注awk可能对您有帮助。

awk 'FNR==NR{a[$0];next} ($2 in a)' file2.txt  file1.txt