瀑布情节GenVisR

Question

我正在使用document功能。正如小插图所暗示的那样，我正在使用自定义值更改顶部图。但是，这些值无法指定，并以灰色显示为＆＃34;未定义＆＃34; （见图）

waterfall from GenVisR package

我想添加一个带ggplot的图层，以便定义（和颜色）条形图，如下图：

在小插图中，作者有一个名为mutBurdenLayer的论据似乎可以完成这项工作，但我无法更改图表。

有什么想法吗？

这是我的代码：

library(GenVisR)
library(ggplot2)
library(RColorBrewer)
custom_pallete <- brewer.pal(8, "Paired")
waterfall(VCFs, coverageSpace = 179977, main_geneLabSize = 5,
          mainLabelSize = 2, mainLabelCol="HGVSp", mainDropMut = T,
          mainPalette = custom_pallete, mainXlabel = T)

我想补充一下：

mut_burden_layer <- theme(...)
waterfall(VCFs, coverageSpace = 179977, main_geneLabSize = 5,
          mainLabelSize = 2, mainLabelCol="HGVSp", mainDropMut = T,
          mainPalette = custom_pallete, mutBurden = mut, mainXlabel = T,
          mutBurdenLayer = mut_burden_layer)

使mutBurden数据表包含新比例，mutBurdenLayer我想要自定义参数。